RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	C22orf24	Q9Y442	160 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	CKS1B	P61024	79 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF727	A8MUV8	499 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	BCE1	O60756	84 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA0087	Q14695	138 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	RGS21	Q2M5E4	152 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM250	H0YL14	139 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	CKS2	P33552	79 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	C20orf78	Q9BR46	151 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2A	P49459	152 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00862	A6NCI5	91 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	GAGE10	A6NGK3	116 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB5A	P20339	215 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM104A	Q969W3	186 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	OSTC	Q9NRP0	149 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZN92	141 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01551	Q86U37	167 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC51B	Q86UW2	128 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM141	Q96I45	108 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511		D6R8Y8	96 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00167	Q96N53	147 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511		V9GYV3	84 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SKAP2-209	ENST00000497511	MT3	P25713	68 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8IZM0	81 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	BATF3	Q9NR55	127 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GW15	77 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511		F8VRH5	84 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511		F8W036	122 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	NPY	P01303	97 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	S100A8	P05109	93 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	CTAG1A	P78358	180 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	VCX2	Q9H322	139 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	PPBP	P02775	128 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	PRLH	P81277	87 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV2D-28	P01615	120 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCL5	P42830	114 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	ADIRF	Q15847	76 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	6.17	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	ORMDL3	Q8N138	153 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	HERVK_113	P63121	156 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC11A	P67812	179 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	PRELID3A	Q96N28	172 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB5B	P61020	215 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SKAP2-209	ENST00000497511	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		6.14	□□□□□ -1.43

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