RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 SMIM6P0DI80 62 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 C14orf177Q52M58 125 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 SFTA2Q6UW10 78 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-211ENST00000497210 PRSS2P07478 247 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 VAMP8Q9BV40 100 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM223A0PJW6 202 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 S100A12P80511 92 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 COX6A2Q02221 97 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 C10orf25Q5T742 122 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 C5orf38Q86SI9 138 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 ATOH7Q8N100 152 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 KMT2AQ03164 3969 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 SPINK8P0C7L1 97 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 CXCL5P42830 114 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 SPAG11BQ08648 103 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 PYY3Q5JQD4 70 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 Q8IZM0 81 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 E9PLD3 99 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 USP17L23D6RBM5 183 aa6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 F8WDY8 70 aa6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 LEPROTO15243 131 aa6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 NMUP48645 174 aa6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 CKS1BP61024 79 aa6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 COX7B2Q8TF08 81 aa6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 hDV102S1A0JD36 115 aa6.41□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.41□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 C15orf56Q8N910 161 aa6.41□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.41□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.41□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 J3QQQ9 107 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 NDUFA1O15239 70 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 SPATA45Q537H7 98 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 STPG4Q8N801 248 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 C2orf48Q96LS8 159 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-211ENST00000497210 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 LECT2O14960 151 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 HERV-K104P63124 156 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 A0A087WTM6 91 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF815PA8K554 130 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00587B1AMM8 73 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 Q8N814 137 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 CARD19Q96LW7 228 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 DNAH2Q9P225 4427 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.37□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.37□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 MAJINQ3KP22 176 aa6.37□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.37□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.37□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 C12orf57Q99622 126 aa6.37□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.36□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 RTL8CO15255 209 aa6.36□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.36□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 SYCNQ0VAF6 134 aa6.36□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 KIAA0087Q14695 138 aa6.36□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.36□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.36□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 TSTD3H0UI37 97 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 COX8AP10176 69 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 RYR2Q92736 4967 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM238C9JI98 176 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 COX17Q14061 63 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 WFDC2Q14508 124 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-211ENST00000497210 DLEU1O43261 78 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 C2orf82Q6UX34 121 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 Q6ZRU5 148 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 PCP2Q8IVA1 136 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms