RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496569.1

HDLBP-246, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-246ENST00000496569 NPSP0C0P6 89 aa7.5□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 HERVK_113P63121 156 aa7.5□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.213e-10■■■■■ 32.5
HDLBP-246ENST00000496569 PMCHL1Q16048 86 aa7.5□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 C1orf137Q5JT78 98 aa7.5□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.5□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.5□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.49□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.49□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 M0QXV9 152 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 SPINK8P0C7L1 97 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 CKS1BP61024 79 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 COX19Q49B96 90 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 Q8IZM0 81 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 G0S2P27469 103 aa7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 LINC01600Q96MT4 127 aa7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 CST9LQ9H4G1 147 aa7.47□□□□□ -1.21
HDLBP-246ENST00000496569 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 SEC11AP67812 179 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 PMVKQ15126 192 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 NDUFA6P56556 154 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 COX7B2Q8TF08 81 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 F8VRH5 84 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 SNAPINO95295 136 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 IGLV7-43P04211 117 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 UBE2BP63146 152 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 NDUFA5Q16718 116 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 REG3GQ6UW15 175 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 SVBPQ8N300 66 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 YPEL4Q96NS1 127 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 LINC00614P0C842 121 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 KRTAP10-8P60410 259 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 LRP2P98164 4655 aa7.42□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 HBDP02042 147 aa7.42□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 RAB5BP61020 215 aa7.42□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.42□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 IGLC3P0DOY3 106 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 C22orf24Q9Y442 160 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 LINC01549A6NIU2 74 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 CXCL5P42830 114 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-246ENST00000496569 C11orf86A6NJI1 115 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 SCO1O75880 301 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 GAGE10A6NGK3 116 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 H0Y9J4 135 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 H3BRM9 83 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 BAGE3Q86Y29 109 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 DIRC1Q969H9 104 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 PFN2P35080 140 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 RNF213Q63HN8 5207 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 ATP5LO75964 103 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 LINC00167Q96N53 147 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 Q8NDZ9 215 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 LPAP08519 4548 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-246ENST00000496569 TRGC2P03986 189 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 LINC00310P59036 64 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 ERG28Q9UKR5 140 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 A0A0U1RRA0 63 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 H0Y8G0 127 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF861PO60384 105 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 HSBP1O75506 76 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 IGKV2D-28P01615 120 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 TMEM223A0PJW6 202 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 NUPR1O60356 82 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 SERF1AO75920 110 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 VPREB1P12018 145 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 BCE1O60756 84 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-246ENST00000496569 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 TMEM238C9JI98 176 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-246ENST00000496569 A0A087X002 238 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 167.2 ms