RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495663.1

RAB11FIP3-211, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene RAB11FIP3, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.6□□□□□ -1.35
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.56□□□□□ -1.36
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C5orf52A6NGY3 159 aa6.55□□□□□ -1.36
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 SPINK8P0C7L1 97 aa6.55□□□□□ -1.36
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.55□□□□□ -1.36
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 LINC01620Q4KN68 170 aa6.52□□□□□ -1.37
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.52□□□□□ -1.37
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PKHD1P08F94 4074 aa6.51□□□□□ -1.37
RAB11FIP3-211ENST00000495663 AKR1D1P51857 326 aa6.51□□□□□ -1.37
RAB11FIP3-211ENST00000495663 HERVK_113P61574 105 aa6.51□□□□□ -1.37
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C2orf82Q6UX34 121 aa6.51□□□□□ -1.37
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.51□□□□□ -1.37
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.5□□□□□ -1.37
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.5□□□□□ -1.37
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C10orf25Q5T742 122 aa6.49□□□□□ -1.37
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.49□□□□□ -1.37
RAB11FIP3-211ENST00000495663 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.48□□□□□ -1.37
RAB11FIP3-211ENST00000495663 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.48□□□□□ -1.37
RAB11FIP3-211ENST00000495663 LEPROTO15243 131 aa6.48□□□□□ -1.37
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SFTA2Q6UW10 78 aa6.48□□□□□ -1.37
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.48□□□□□ -1.37
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.47□□□□□ -1.37
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.46□□□□□ -1.38
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RAB11FIP3-211ENST00000495663 A0A096LNI7 61 aa6.45□□□□□ -1.38
RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.45□□□□□ -1.38
RAB11FIP3-211ENST00000495663 J3QQQ9 107 aa6.45□□□□□ -1.38
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SCGB1D1O95968 90 aa6.45□□□□□ -1.38
RAB11FIP3-211ENST00000495663 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RAB11FIP3-211ENST00000495663 Q6ZSA8 131 aa6.45□□□□□ -1.38
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ATOH7Q8N100 152 aa6.45□□□□□ -1.38
RAB11FIP3-211ENST00000495663 STPG4Q8N801 248 aa6.45□□□□□ -1.38
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RAB11FIP3-211ENST00000495663 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.45□□□□□ -1.38
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.44□□□□□ -1.38
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