RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491036.2

LAMA5-210, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 728 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-210ENST00000491036 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.81□□□□□ -0.84
LAMA5-210ENST00000491036 SMCO4Q9NRQ5 59 aa9.81□□□□□ -0.84
LAMA5-210ENST00000491036 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.81□□□□□ -0.84
LAMA5-210ENST00000491036 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.8□□□□□ -0.84
LAMA5-210ENST00000491036 PRSS2P07478 247 aa9.8□□□□□ -0.84
LAMA5-210ENST00000491036 ORMDL2Q53FV1 153 aa9.8□□□□□ -0.84
LAMA5-210ENST00000491036 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.8□□□□□ -0.84
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.8□□□□□ -0.84
LAMA5-210ENST00000491036 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.8□□□□□ -0.84
LAMA5-210ENST00000491036 H0Y9J4 135 aa9.79□□□□□ -0.84
LAMA5-210ENST00000491036 AMELXQ99217 191 aa9.79□□□□□ -0.84
LAMA5-210ENST00000491036 K7EMI3 77 aa9.78□□□□□ -0.84
LAMA5-210ENST00000491036 CKS1BP61024 79 aa9.78□□□□□ -0.84
LAMA5-210ENST00000491036 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
LAMA5-210ENST00000491036 IGIPA6NJ69 53 aa9.77□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.77□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 NPSP0C0P6 89 aa9.76□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 C18orf32Q8TCD1 76 aa9.76□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 LINC01546A6NGU7 62 aa9.75□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.75□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.75□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 SCO1O75880 301 aa9.74□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 G0S2P27469 103 aa9.74□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 HERVK_113P63121 156 aa9.74□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 SEC11AP67812 179 aa9.74□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.74□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 FA2HQ7L5A8 372 aa9.74□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.74□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 Q8IZM0 81 aa9.74□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 TOMM6Q96B49 74 aa9.74□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.73□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.72□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.72□□□□□ -0.85
LAMA5-210ENST00000491036 COLCA2A8K830 154 aa9.71□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 TIMM17AQ99595 171 aa9.71□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 C22orf24Q9Y442 160 aa9.71□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 RNF213Q63HN8 5207 aa9.71□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 TRGC2P03986 189 aa9.7□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.7□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.7□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 A0A096LNJ9 63 aa9.69□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 F8VRH5 84 aa9.69□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 LINC00614P0C842 121 aa9.69□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 PMCHL1Q16048 86 aa9.69□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 ERASQ7Z444 233 aa9.69□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 NUPR1O60356 82 aa9.67□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 ZNF861PO60384 105 aa9.67□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 CXCL5P42830 114 aa9.67□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 LPAP08519 4548 aa9.66□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 LINC01549A6NIU2 74 aa9.65□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.65□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 HBDP02042 147 aa9.65□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 RAB5BP61020 215 aa9.65□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 COX7B2Q8TF08 81 aa9.65□□□□□ -0.86
LAMA5-210ENST00000491036 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.64□□□□□ -0.87
LAMA5-210ENST00000491036 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.64□□□□□ -0.87
LAMA5-210ENST00000491036 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.63□□□□□ -0.87
LAMA5-210ENST00000491036 SPINK8P0C7L1 97 aa9.62□□□□□ -0.87
LAMA5-210ENST00000491036 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
LAMA5-210ENST00000491036 CST9LQ9H4G1 147 aa9.62□□□□□ -0.87
LAMA5-210ENST00000491036 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.61□□□□□ -0.87
LAMA5-210ENST00000491036 ATP6V1G1O75348 118 aa9.61□□□□□ -0.87
LAMA5-210ENST00000491036 LINC00310P59036 64 aa9.61□□□□□ -0.87
LAMA5-210ENST00000491036 PRR4Q16378 134 aa9.61□□□□□ -0.87
LAMA5-210ENST00000491036 BAGE3Q86Y29 109 aa9.61□□□□□ -0.87
LAMA5-210ENST00000491036 LINC00167Q96N53 147 aa9.61□□□□□ -0.87
LAMA5-210ENST00000491036 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.6□□□□□ -0.87
LAMA5-210ENST00000491036 BCE1O60756 84 aa9.6□□□□□ -0.87
LAMA5-210ENST00000491036 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
LAMA5-210ENST00000491036 PMVKQ15126 192 aa9.6□□□□□ -0.87
LAMA5-210ENST00000491036 GAGE10A6NGK3 116 aa9.59□□□□□ -0.87
LAMA5-210ENST00000491036 SERF1AO75920 110 aa9.59□□□□□ -0.87
LAMA5-210ENST00000491036 HSBP1O75506 76 aa9.58□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 NDUFA6P56556 154 aa9.58□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.58□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 H3BRM9 83 aa9.57□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 ATP5LO75964 103 aa9.57□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 TSPAN13O95857 204 aa9.57□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.57□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 S100A1P23297 94 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 A0A087X002 238 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 HIST1H2BKO60814 126 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 HIST1H2BJP06899 126 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 IGLC3P0DOY3 106 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 CRYGAP11844 174 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 HIST1H2BOP23527 126 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 HIST1H2BBP33778 126 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 PFN2P35080 140 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 UBE2AP49459 152 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 HIST1H2BDP58876 126 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 HIST1H2BCP62807 126 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 HIST2H2BEQ16778 126 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMA5-210ENST00000491036 HIST1H2BNQ99877 126 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms