RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487065.5

STAG1-208, Transcript of stromal antigen 1, human

TSL 1 (best)

Gene STAG1, Length 2,914 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STAG1-208	ENST00000487065	PKD1	P98161	4303 aa		4.96	□□□□□ -1.61
STAG1-208	ENST00000487065	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065		A0A0B4J2C4	111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065		A0A0J9YY99	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065		A6NDN8	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065		A0A0J9YXV3	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065		Q6ZTC4	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065		Q9UF83	564 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	LITAF	Q99732	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	NDUFC2	O95298	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	FOXI1	Q12951	378 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	CEND1	Q8N111	149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	CCL18	P55774	89 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	REG3A	Q06141	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	COX7A2L	O14548	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	STPG4	Q8N801	248 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	GAGE6	Q13070	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	ESRG	Q1W209	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	TNP2	Q05952	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	BATF	Q16520	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
STAG1-208	ENST00000487065	COX6A2	Q02221	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065		Q5VSD8	79 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065		H3BQ85	93 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	CRP	P02741	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065		A0A1B0GX51	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	XG	P55808	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065		H0Y8G0	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	DEFB4A	O15263	64 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STAG1-208	ENST00000487065	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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