RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482195.5

DDX39B-220, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 1,232 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-220ENST00000482195 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
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DDX39B-220ENST00000482195 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
DDX39B-220ENST00000482195 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.1□□□□□ -1.43
DDX39B-220ENST00000482195 TMEM141Q96I45 108 aa6.1□□□□□ -1.43
DDX39B-220ENST00000482195 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.1□□□□□ -1.43
DDX39B-220ENST00000482195 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-220ENST00000482195 A0A1B0GW15 77 aa6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-220ENST00000482195 F8W036 122 aa6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-220ENST00000482195 S100A8P05109 93 aa6.09□□□□□ -1.43
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DDX39B-220ENST00000482195 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
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DDX39B-220ENST00000482195 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.09□□□□□ -1.43
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DDX39B-220ENST00000482195 C22orf24Q9Y442 160 aa6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-220ENST00000482195 MUC17Q685J3 4493 aa6.08□□□□□ -1.44
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DDX39B-220ENST00000482195 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.08□□□□□ -1.44
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DDX39B-220ENST00000482195 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.07□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 Q6ZN92 141 aa6.07□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 NAT8Q9UHE5 227 aa6.07□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.06□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.06□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.06□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 AKAP14Q86UN6 197 aa6.06□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 ORMDL3Q8N138 153 aa6.06□□□□□ -1.44
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DDX39B-220ENST00000482195 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.05□□□□□ -1.44
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DDX39B-220ENST00000482195 PPBPP02775 128 aa6.05□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 LCE3BQ5TA77 95 aa6.05□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.05□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.05□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.05□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.05□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 UBE2AP49459 152 aa6.04□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 Q8IZM0 81 aa6.04□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.04□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 VCX2Q9H322 139 aa6.04□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.04□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.04□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 A0A1B0GXF2 115 aa6.03□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.03□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.03□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.03□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.03□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.03□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.03□□□□□ -1.44
DDX39B-220ENST00000482195 F8VRH5 84 aa6.02□□□□□ -1.45
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DDX39B-220ENST00000482195 HERVK_113P63121 156 aa6.01□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.01□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.01□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 LINC00167Q96N53 147 aa6.01□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 C9JQL5 133 aa6□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 CXCL5P42830 114 aa6□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 ORMDL2Q53FV1 153 aa6□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 Q8N8P6 123 aa6□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 AMELXQ99217 191 aa6□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.99□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.99□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 SEC11AP67812 179 aa5.99□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 PEA15Q15121 130 aa5.99□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.99□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.98□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 IGKV2D-28P01615 120 aa5.98□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 RAB5BP61020 215 aa5.98□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 TPRXLQ17RH7 258 aa5.98□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.98□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 COX7B2Q8TF08 81 aa5.98□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.98□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 SCO1O75880 301 aa5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 PRLHP81277 87 aa5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-220ENST00000482195 IGIPA6NJ69 53 aa5.96□□□□□ -1.46
DDX39B-220ENST00000482195 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.96□□□□□ -1.46
DDX39B-220ENST00000482195 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.96□□□□□ -1.46
DDX39B-220ENST00000482195 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.96□□□□□ -1.46
DDX39B-220ENST00000482195 SPINK8P0C7L1 97 aa5.95□□□□□ -1.46
DDX39B-220ENST00000482195 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.95□□□□□ -1.46
DDX39B-220ENST00000482195 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.95□□□□□ -1.46
DDX39B-220ENST00000482195 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
DDX39B-220ENST00000482195 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.94□□□□□ -1.46
DDX39B-220ENST00000482195 VPREB1P12018 145 aa5.94□□□□□ -1.46
DDX39B-220ENST00000482195 PDZD11Q5EBL8 140 aa5.94□□□□□ -1.46
DDX39B-220ENST00000482195 TIMM17AQ99595 171 aa5.94□□□□□ -1.46
DDX39B-220ENST00000482195 TMEM238C9JI98 176 aa5.93□□□□□ -1.46
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