RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481220.5

SNHG12-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, human

TSL 3

Gene SNHG12, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG12-208	ENST00000481220	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SNHG12-208	ENST00000481220	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SNHG12-208	ENST00000481220	LINC01549	A6NIU2	74 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNHG12-208	ENST00000481220	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNHG12-208	ENST00000481220	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SNHG12-208	ENST00000481220	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	PRSS2	P07478	247 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	REG3G	Q6UW15	175 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	CST9L	Q9H4G1	147 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	CKS1B	P61024	79 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	C1orf137	Q5JT78	98 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220		A0A096LNJ9	63 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	FA2H	Q7L5A8	372 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220		F8VRH5	84 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	ODF1	Q14990	250 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220		M0QXV9	152 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	APOC3	P02656	99 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	IGLV7-43	P04211	117 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	PMVK	Q15126	192 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SNHG12-208	ENST00000481220	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SNHG12-208	ENST00000481220	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SNHG12-208	ENST00000481220	CXCL5	P42830	114 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SNHG12-208	ENST00000481220	LINC00614	P0C842	121 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SNHG12-208	ENST00000481220	SVBP	Q8N300	66 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SNHG12-208	ENST00000481220	COX7B2	Q8TF08	81 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SNHG12-208	ENST00000481220	YPEL4	Q96NS1	127 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SNHG12-208	ENST00000481220	SNAPIN	O95295	136 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG12-208	ENST00000481220	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG12-208	ENST00000481220	SPINK8	P0C7L1	97 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SNHG12-208	ENST00000481220	IGLC3	P0DOY3	106 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SNHG12-208	ENST00000481220	DIRC1	Q969H9	104 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SNHG12-208	ENST00000481220	C22orf24	Q9Y442	160 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SNHG12-208	ENST00000481220	UBE2B	P63146	152 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SNHG12-208	ENST00000481220	PMCHL1	Q16048	86 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SNHG12-208	ENST00000481220	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SNHG12-208	ENST00000481220		H0Y9J4	135 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SNHG12-208	ENST00000481220	HBD	P02042	147 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SNHG12-208	ENST00000481220	NDUFA5	Q16718	116 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SNHG12-208	ENST00000481220	LRP2	P98164	4655 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SNHG12-208	ENST00000481220	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG12-208	ENST00000481220		H3BRM9	83 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG12-208	ENST00000481220	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG12-208	ENST00000481220	NDUFA6	P56556	154 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SNHG12-208	ENST00000481220	RAB5B	P61020	215 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SNHG12-208	ENST00000481220	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
SNHG12-208	ENST00000481220	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
SNHG12-208	ENST00000481220	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SNHG12-208	ENST00000481220	ATP5L	O75964	103 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SNHG12-208	ENST00000481220	C11orf86	A6NJI1	115 aa		10.94	□□□□□ -0.66
SNHG12-208	ENST00000481220	NUPR1	O60356	82 aa		10.94	□□□□□ -0.66
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF861P	O60384	105 aa		10.94	□□□□□ -0.66
SNHG12-208	ENST00000481220	BAGE3	Q86Y29	109 aa		10.94	□□□□□ -0.66
SNHG12-208	ENST00000481220	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		10.93	□□□□□ -0.66
SNHG12-208	ENST00000481220	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	10.92	□□□□□ -0.66
SNHG12-208	ENST00000481220	LINC00167	Q96N53	147 aa		10.92	□□□□□ -0.66
SNHG12-208	ENST00000481220	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		10.91	□□□□□ -0.66
SNHG12-208	ENST00000481220	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		10.9	□□□□□ -0.66
SNHG12-208	ENST00000481220	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	BCE1	O60756	84 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	PFN2	P35080	140 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	ERG28	Q9UKR5	140 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	COX17	Q14061	63 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	GAGE10	A6NGK3	116 aa		10.86	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		10.86	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM223	A0PJW6	202 aa		10.85	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	SCO1	O75880	301 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	TRGC2	P03986	189 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	VPREB1	P12018	145 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	SFTA2	Q6UW10	78 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220		Q8NDZ9	215 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG12-208	ENST00000481220	LINC00310	P59036	64 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG12-208	ENST00000481220	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG12-208	ENST00000481220	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG12-208	ENST00000481220	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG12-208	ENST00000481220	RNF213	Q63HN8	5207 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG12-208	ENST00000481220	HSBP1	O75506	76 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SNHG12-208	ENST00000481220	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SNHG12-208	ENST00000481220	LPA	P08519	4548 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG12-208	ENST00000481220	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG12-208	ENST00000481220	IGKV2D-28	P01615	120 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNHG12-208	ENST00000481220		A0A087X002	238 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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