RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa13.07□□□□□ -0.32
NELFE-208ENST00000481121 TLX1NBP0CAT3 122 aa13.07□□□□□ -0.32
NELFE-208ENST00000481121 NDUFA6P56556 154 aa13.07□□□□□ -0.32
NELFE-208ENST00000481121 PDZD11Q5EBL8 140 aa13.07□□□□□ -0.32
NELFE-208ENST00000481121 C6orf226Q5I0X4 101 aa13.07□□□□□ -0.32
NELFE-208ENST00000481121 ATP5LO75964 103 aa13.06□□□□□ -0.32
NELFE-208ENST00000481121 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
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NELFE-208ENST00000481121 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
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NELFE-208ENST00000481121 COLCA2A8K830 154 aa12.98□□□□□ -0.33
NELFE-208ENST00000481121 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
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NELFE-208ENST00000481121 J3QL48 77 aa12.95□□□□□ -0.34
NELFE-208ENST00000481121 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
NELFE-208ENST00000481121 FAM19A2Q8N3H0 131 aa12.95□□□□□ -0.34
NELFE-208ENST00000481121 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
NELFE-208ENST00000481121 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
NELFE-208ENST00000481121 C11orf86A6NJI1 115 aa12.93□□□□□ -0.34
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NELFE-208ENST00000481121 SERF1AO75920 110 aa12.93□□□□□ -0.34
NELFE-208ENST00000481121 HERC1Q15751 4861 aa12.93□□□□□ -0.34
NELFE-208ENST00000481121 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
NELFE-208ENST00000481121 TMEM170BQ5T4T1 132 aa12.93□□□□□ -0.34
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NELFE-208ENST00000481121 OXTP01178 125 aa12.91□□□□□ -0.34
NELFE-208ENST00000481121 M0QXV9 152 aa12.89□□□□□ -0.35
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NELFE-208ENST00000481121 LEPROTL1O95214 131 aa12.88□□□□□ -0.35
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NELFE-208ENST00000481121 H0Y8G0 127 aa12.86□□□□□ -0.35
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NELFE-208ENST00000481121 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa12.84□□□□□ -0.35
NELFE-208ENST00000481121 UBE2BP63146 152 aa12.83□□□□□ -0.35
NELFE-208ENST00000481121 C1orf137Q5JT78 98 aa12.83□□□□□ -0.35
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NELFE-208ENST00000481121 SPINK6Q6UWN8 80 aa12.83□□□□□ -0.36
NELFE-208ENST00000481121 FABP4P15090 132 aa12.82□□□□□ -0.36
NELFE-208ENST00000481121 HIST1H2BKO60814 126 aa12.81□□□□□ -0.36
NELFE-208ENST00000481121 HIST1H2BJP06899 126 aa12.81□□□□□ -0.36
NELFE-208ENST00000481121 HIST1H2BOP23527 126 aa12.81□□□□□ -0.36
NELFE-208ENST00000481121 HIST1H2BBP33778 126 aa12.81□□□□□ -0.36
NELFE-208ENST00000481121 HIST1H2BDP58876 126 aa12.81□□□□□ -0.36
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NELFE-208ENST00000481121 HIST2H2BEQ16778 126 aa12.81□□□□□ -0.36
NELFE-208ENST00000481121 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
NELFE-208ENST00000481121 HIST1H2BHQ93079 126 aa12.81□□□□□ -0.36
NELFE-208ENST00000481121 HIST1H2BNQ99877 126 aa12.81□□□□□ -0.36
NELFE-208ENST00000481121 HIST1H2BMQ99879 126 aa12.81□□□□□ -0.36
NELFE-208ENST00000481121 PFN2P35080 140 aa12.8□□□□□ -0.36
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa12.8□□□□□ -0.36
NELFE-208ENST00000481121 ERG28Q9UKR5 140 aa12.8□□□□□ -0.36
NELFE-208ENST00000481121 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
NELFE-208ENST00000481121 C22orf24Q9Y442 160 aa12.79□□□□□ -0.36
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NELFE-208ENST00000481121 TP73-AS1Q9UF72 201 aa12.77□□□□□ -0.37
NELFE-208ENST00000481121 PLNP26678 52 aa12.76□□□□□ -0.37
NELFE-208ENST00000481121 REG3GQ6UW15 175 aa12.76□□□□□ -0.37
NELFE-208ENST00000481121 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
NELFE-208ENST00000481121 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa12.76□□□□□ -0.37
NELFE-208ENST00000481121 IGLV7-43P04211 117 aa12.75□□□□□ -0.37
NELFE-208ENST00000481121 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa12.75□□□□□ -0.37
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NELFE-208ENST00000481121 NKAPP1Q8N9T2 125 aa12.72□□□□□ -0.37
NELFE-208ENST00000481121 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa12.72□□□□□ -0.37
NELFE-208ENST00000481121 PMCHL2Q9BQD1 86 aa12.72□□□□□ -0.37
NELFE-208ENST00000481121 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa12.71□□□□□ -0.38
NELFE-208ENST00000481121 MT1HL1P0DM35 61 aa12.71□□□□□ -0.38
NELFE-208ENST00000481121 IGKCP01834 107 aa12.7□□□□□ -0.38
NELFE-208ENST00000481121 LINC01600Q96MT4 127 aa12.7□□□□□ -0.38
NELFE-208ENST00000481121 LINC00158P58513 81 aa12.69□□□□□ -0.38
NELFE-208ENST00000481121 HERVK_113P61574 105 aa12.69□□□□□ -0.38
NELFE-208ENST00000481121 HERV-K104P63124 156 aa12.68□□□□□ -0.38
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