RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 IGIPA6NJ69 53 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 NUPR1O60356 82 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 BCE1O60756 84 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 Q8IZM0 81 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 Q8N8P6 123 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 LINC00167Q96N53 147 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 CRYGAP11844 174 aa6.54□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 PRSS47A8MTI9 375 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 F8VRH5 84 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 RAB5BP61020 215 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 A0A0U1RQV1 116 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 ADCYAP1P18509 176 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.5□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 IGKV2D-28P01615 120 aa6.5□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 HERVK_113P63121 156 aa6.5□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.5□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 SPINK8P0C7L1 97 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 UBE2AP49459 152 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 PRLHP81277 87 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 COX7B2Q8TF08 81 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 TMEM238C9JI98 176 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 TOMM6Q96B49 74 aa6.47□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.47□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 CDIP1Q9H305 208 aa6.47□□□□□ -1.37
ACTB-209ENST00000473257 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 Q8NDZ9 215 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 TIMM17AQ99595 171 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 MT-ND4LP03901 98 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 NPSP0C0P6 89 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 PFN2P35080 140 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 SEC11AP67812 179 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.44□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.44□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 CXCL5P42830 114 aa6.44□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 ERASQ7Z444 233 aa6.44□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.44□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 CST9LQ9H4G1 147 aa6.44□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.43□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.43□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.43□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.43□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 K7EMI3 77 aa6.42□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 VPREB1P12018 145 aa6.42□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 TPRXLQ17RH7 258 aa6.42□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 TMEM126AQ9H061 195 aa6.42□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 M0R378 163 aa6.41□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 RAB14P61106 215 aa6.41□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.41□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.41□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.41□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 ATP5LO75964 103 aa6.4□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.4□□□□□ -1.38
ACTB-209ENST00000473257 NDUFA6P56556 154 aa6.39□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 PMVKQ15126 192 aa6.39□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.39□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.39□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 G0S2P27469 103 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 DAND5Q8N907 189 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 ERG28Q9UKR5 140 aa6.38□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.37□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 A0A0U1RRA0 63 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 LINC01546A6NGU7 62 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 H3BRM9 83 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 PMCHL1Q16048 86 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 FA2HQ7L5A8 372 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 A0A096LNJ9 63 aa6.35□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 IGLC3P0DOY3 106 aa6.35□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 SPRR4Q96PI1 79 aa6.35□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 Q8NBF4 154 aa6.34□□□□□ -1.39
ACTB-209ENST00000473257 C11orf86A6NJI1 115 aa6.33□□□□□ -1.4
ACTB-209ENST00000473257 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ACTB-209ENST00000473257 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.33□□□□□ -1.4
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.33□□□□□ -1.4
ACTB-209ENST00000473257 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.33□□□□□ -1.4
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