RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472218.1

RPS18-231, Transcript of ribosomal protein S18, human

TSL 2

Gene RPS18, Length 1,109 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS18-231	ENST00000472218	IFITM1	P13164	125 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	CKS1B	P61024	79 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	SPAG11B	Q08648	103 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	COX17	Q14061	63 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	C2orf48	Q96LS8	159 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	SPANXC	Q9NY87	97 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	7.19	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	CASC10	Q5T4H9	136 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	HIST1H4G	Q99525	98 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	TENM2	Q9NT68	2774 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218		A6NJY4	79 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	CEND1	Q8N111	149 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	LITAF	Q99732	161 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218		Q9HAA7	133 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	C14orf177	Q52M58	125 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218		A6NDN8	102 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	C15orf56	Q8N910	161 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	RNF151	Q2KHN1	245 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218		Q6ZR54	194 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	ERG28	Q9UKR5	140 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RPS18-231	ENST00000472218	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218		A0A1B0GWB2	263 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	USP17L23	D6RBM5	183 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	PSCA	O43653	123 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	SMIM13	P0DJ93	91 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	LINC00158	P58513	81 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	C2orf82	Q6UX34	121 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	FXYD2	P54710	66 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	SYCN	Q0VAF6	134 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	C6orf223	Q8N319	242 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218		A0A0B4J2C4	111 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	EREG	O14944	169 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	LY6G6C	O95867	125 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	BATF	Q16520	125 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	C10orf25	Q5T742	122 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	CARD19	Q96LW7	228 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RPS18-231	ENST00000472218	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218		A4D1N5	150 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	NDUFC2	O95298	119 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	PFN2	P35080	140 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218		Q6ZRU5	148 aa		7.08	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		7.07	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218		A0A0U1RRA0	63 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	CFC1B	P0CG36	223 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	CFC1	P0CG37	223 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	DAND5	Q8N907	189 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	LYST	Q99698	3801 aa		7.06	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	RAB37	Q96AX2	223 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		7.05	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218		M0R2N4	97 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	TAX1BP3	O14907	124 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	SLPI	P03973	132 aa		7.04	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218		A0A087WTM6	91 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	C9orf118	A6NHY6	69 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RPS18-231	ENST00000472218	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RPS18-231	ENST00000472218	WFDC2	Q14508	124 aa		7.02	□□□□□ -1.29

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