RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	UQCRQ	O14949	82 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBBP4-208	ENST00000463378	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBBP4-208	ENST00000463378	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBBP4-208	ENST00000463378	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBBP4-208	ENST00000463378	PLXNB1	O43157	2135 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBBP4-208	ENST00000463378	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RBBP4-208	ENST00000463378	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	REV3L	O60673	3130 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378		J3KT08	172 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	ATOX1	O00244	68 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	DNAL4	O96015	105 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	TRAC	P01848	142 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	NPC2	P61916	151 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	CLEC2B	Q92478	149 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	NDUFA1	O15239	70 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	CAD	P27708	2225 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A1B0GX51	115 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378		H0YGX0	51 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	HTN1	P15515	57 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	COX7C	P15954	63 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	TECTA	O75443	2155 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	KNCN	A6PVL3	124 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	CRP	P02741	224 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC00694	P0DN24	101 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	DEFB1	P60022	68 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	DCANP1	Q8TF63	244 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378		H3BUX3	64 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	CRYGA	P11844	174 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	C5orf38	Q86SI9	138 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	LAMA1	P25391	3075 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378		H3BPC8	53 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM258	P61165	79 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	PLCE1	Q9P212	2302 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RBBP4-208	ENST00000463378	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A1W2PNN7	141 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378		A8MUN3	132 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC00158	P58513	81 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	DEFB131A	P59861	70 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	BLCAP	P62952	87 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378		Q6JHZ5	121 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	SERP2	Q8N6R1	65 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	C3orf56	Q8N813	242 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	C16orf95	Q9H693	158 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	LAMA3	Q16787	3333 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	hADV29S1	A0JD25	119 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	PSMB8	P28062	276 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	COX7B2	Q8TF08	81 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	NCOR1	O75376	2440 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	ABCA1	O95477	2261 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A1W2PNM2	257 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378		B4DSR2	109 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	NDUFC2	O95298	119 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	MSMB	P08118	114 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	COX6A2	Q02221	97 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	CCL19	Q99731	98 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	UBL5	Q9BZL1	73 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	CDH23	Q9H251	3354 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		3.12	□□□□□ -1.91

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