RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf3-211ENST00000463372 Q6ZN92 141 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf3-211ENST00000463372 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf3-211ENST00000463372 LINC00483Q53H64 154 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf3-211ENST00000463372 CENPWQ5EE01 88 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf3-211ENST00000463372 TIMM17AQ99595 171 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf3-211ENST00000463372 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf3-211ENST00000463372 AKAP14Q86UN6 197 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf3-211ENST00000463372 LIMD2Q9BT23 127 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf3-211ENST00000463372 NRACQ8N912 160 aa6.77□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 BIN3Q9NQY0 253 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP5-9P26371 169 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 CXCL5P42830 114 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 SMIM12Q96EX1 92 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 PPP1R17O96001 155 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 GNG4P50150 75 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 RAB5BP61020 215 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 NUDT11Q96G61 164 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 SMKR1H3BMG3 65 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 PPP1R2P9O14990 202 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 TCAPO15273 167 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 RAB4AP20338 218 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1B0GV50 99 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 VPREB1P12018 145 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.7□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.7□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.7□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 SSNA1O43805 119 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 CCL20P78556 96 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 AMN1Q8IY45 258 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 BORCS7Q96B45 105 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.68□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 C11orf52Q96A22 123 aa6.68□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM141Q96I45 108 aa6.68□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.67□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.66□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.66□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 MED9Q9NWA0 146 aa6.66□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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C9orf3-211ENST00000463372 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.65□□□□□ -1.34
C9orf3-211ENST00000463372 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 C20orf78Q9BR46 151 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 C6orf99Q4VX62 202 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 ENKURQ8TC29 256 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1B0GUT8 65 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 PRSS47A8MTI9 375 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 FAM236CP0DP71 79 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 COX7B2Q8TF08 81 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 A8MWL6 223 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 PFN2P35080 140 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 HERVK_113P63121 156 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 S100ZQ8WXG8 99 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 PRYO14603 147 aa6.59□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.59□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.59□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 MANBALQ9NQG1 85 aa6.59□□□□□ -1.35
C9orf3-211ENST00000463372 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 SEC11AP67812 179 aa6.58□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 VCX2Q9H322 139 aa6.58□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 ATP5LO75964 103 aa6.57□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 ERC2-IT1O76042 136 aa6.57□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 Q8NDZ9 215 aa6.57□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 GNG13Q9P2W3 67 aa6.57□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.56□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 A6NN06 94 aa6.56□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.56□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 K7EN84 100 aa6.55□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 RAB5AP20339 215 aa6.55□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 SPRR1AP35321 89 aa6.55□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.55□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 LINC00862A6NCI5 91 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 HIGD1CA8MV81 97 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf3-211ENST00000463372 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.54□□□□□ -1.36
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