RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 C2orf48Q96LS8 159 aa7.01□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.01□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 FAT1Q14517 4588 aa7□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 LEPROTL1O95214 131 aa7□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 SEC11AP67812 179 aa6.99□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 GAGE2BQ13066 116 aa6.99□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.99□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.99□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A087WYN8 130 aa6.98□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 NDUFA1O15239 70 aa6.98□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 ODF1Q14990 250 aa6.98□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 MAJINQ3KP22 176 aa6.98□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 Q8N1X5 172 aa6.98□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.97□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.97□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.97□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 Q8IZM0 81 aa6.97□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 COX7B2Q8TF08 81 aa6.97□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 DPH3Q96FX2 82 aa6.97□□□□□ -1.29
RPRD1B-202ENST00000449186 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.96□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 F8VRH5 84 aa6.96□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 PRSS2P07478 247 aa6.96□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 Q6ZRP5 223 aa6.96□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.95□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1W2PNN7 141 aa6.95□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 PTTG1IPP53801 180 aa6.95□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 CKS1BP61024 79 aa6.95□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 GAGE2EQ4V326 116 aa6.95□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 Q5VSD8 79 aa6.95□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 STPG4Q8N801 248 aa6.95□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.95□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.95□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM223A0PJW6 202 aa6.94□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM168BA1KXE4 195 aa6.94□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 H3BRM9 83 aa6.94□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 RNF151Q2KHN1 245 aa6.94□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 EPM2AB3EWF7 344 aa6.93□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.93□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.93□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.92□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 F8WDY8 70 aa6.92□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.92□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.91□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 C3orf79P0CE67 100 aa6.91□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.91□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.91□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.91□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.91□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.9□□□□□ -1.3
RPRD1B-202ENST00000449186 DPM2O94777 84 aa6.89□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTDAPP60985 99 aa6.89□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.89□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.89□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.89□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM229AH3BQW9 127 aa6.88□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 IGKCP01834 107 aa6.88□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 PFN2P35080 140 aa6.88□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 CXCL5P42830 114 aa6.88□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.88□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC01545Q5VT33 79 aa6.88□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A0U1RRA0 63 aa6.87□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 PLNP26678 52 aa6.87□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.87□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 PET117Q6UWS5 81 aa6.86□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 ATOH7Q8N100 152 aa6.86□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.86□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 ERG28Q9UKR5 140 aa6.86□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 Q8NDZ9 215 aa6.85□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.85□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.84□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.84□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 LEPROTO15243 131 aa6.84□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.84□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.84□□□□□ -1.31
RPRD1B-202ENST00000449186 J3QQQ9 107 aa6.83□□□□□ -1.32
RPRD1B-202ENST00000449186 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RPRD1B-202ENST00000449186 S100A6P06703 90 aa6.83□□□□□ -1.32
RPRD1B-202ENST00000449186 SMIM13P0DJ93 91 aa6.83□□□□□ -1.32
RPRD1B-202ENST00000449186 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.83□□□□□ -1.32
RPRD1B-202ENST00000449186 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.83□□□□□ -1.32
RPRD1B-202ENST00000449186 C5orf52A6NGY3 159 aa6.82□□□□□ -1.32
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