RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 A0A087WZ39 114 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 LINC01620Q4KN68 170 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 MALP21145 153 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 TMEM223A0PJW6 202 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 SPINK8P0C7L1 97 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 HERVK_113P61574 105 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 APOMO95445 188 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 STPG4Q8N801 248 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 hDV102S1A0JD36 115 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 SMIM6P0DI80 62 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZSA8 131 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 SCXQ7RTU7 201 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 CFAP161Q6P656 301 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 USP17L23D6RBM5 183 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 E9PLD3 99 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 MAJINQ3KP22 176 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 C15orf56Q8N910 161 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 VAMP8Q9BV40 100 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-208ENST00000438888 LEPROTO15243 131 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 SPAG11BQ08648 103 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 COX7B2Q8TF08 81 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 PRSS2P07478 247 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 Q8IZM0 81 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 J3QQQ9 107 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 NMUP48645 174 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 S100A12P80511 92 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 KIAA0087Q14695 138 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 C14orf177Q52M58 125 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 SPATA45Q537H7 98 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 CXCL5P42830 114 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 CKS1BP61024 79 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 C2orf48Q96LS8 159 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 C12orf57Q99622 126 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-208ENST00000438888 F8WDY8 70 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 NDUFA1O15239 70 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 SFTA2Q6UW10 78 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 PCP2Q8IVA1 136 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 ZNF815PA8K554 130 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 C2orf82Q6UX34 121 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 COX8AP10176 69 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 SYCNQ0VAF6 134 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 HERV-K104P63124 156 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 C14orf144Q96I85 54 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 CARD19Q96LW7 228 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 SLPIP03973 132 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 C10orf25Q5T742 122 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZRU5 148 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 DLEU1O43261 78 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 OXTP01178 125 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-208ENST00000438888 A0A0J9YXY3 114 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 RNF151Q2KHN1 245 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 PRO1933Q9H354 126 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-208ENST00000438888 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.95□□□□□ -1.14
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