RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
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HERC3-206ENST00000431413 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.21□□□□□ -0.94
HERC3-206ENST00000431413 TOMM6Q96B49 74 aa9.21□□□□□ -0.94
HERC3-206ENST00000431413 ERASQ7Z444 233 aa9.2□□□□□ -0.94
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.2□□□□□ -0.94
HERC3-206ENST00000431413 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.2□□□□□ -0.94
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HERC3-206ENST00000431413 CXCL5P42830 114 aa9.19□□□□□ -0.94
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HERC3-206ENST00000431413 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.18□□□□□ -0.94
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HERC3-206ENST00000431413 SEC11CQ9BY50 192 aa9.14□□□□□ -0.95
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HERC3-206ENST00000431413 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
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HERC3-206ENST00000431413 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
HERC3-206ENST00000431413 H3BRM9 83 aa9.1□□□□□ -0.95
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HERC3-206ENST00000431413 VPREB1P12018 145 aa8.93□□□□□ -0.98
HERC3-206ENST00000431413 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.93□□□□□ -0.98
HERC3-206ENST00000431413 SVBPQ8N300 66 aa8.93□□□□□ -0.98
HERC3-206ENST00000431413 SCO1O75880 301 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-206ENST00000431413 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-206ENST00000431413 TMEM126AQ9H061 195 aa8.92□□□□□ -0.98
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