RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 S100A12P80511 92 aa6.78□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C15orf56Q8N910 161 aa6.78□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.78□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.78□□□□□ -1.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A087WTM6 91 aa6.77□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.77□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 E9PLD3 99 aa6.77□□□□□ -1.33
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMIM6P0DI80 62 aa6.77□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PYY3Q5JQD4 70 aa6.77□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STPG4Q8N801 248 aa6.77□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.77□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.77□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.76□□□□□ -1.33
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RTL8CO15255 209 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NMUP48645 174 aa6.76□□□□□ -1.33
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.75□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.75□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q8N814 137 aa6.75□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CARD19Q96LW7 228 aa6.75□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.75□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.75□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.75□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HERV-K104P63124 156 aa6.74□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SYCNQ0VAF6 134 aa6.74□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPATA45Q537H7 98 aa6.74□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF815PA8K554 130 aa6.73□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00587B1AMM8 73 aa6.73□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WFDC2Q14508 124 aa6.73□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAJINQ3KP22 176 aa6.73□□□□□ -1.33
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIAA0087Q14695 138 aa6.72□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C2orf82Q6UX34 121 aa6.72□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDIP1Q9H305 208 aa6.72□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.72□□□□□ -1.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.71□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.71□□□□□ -1.34
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.71□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LCE4AQ5TA78 99 aa6.71□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.71□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.71□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RNF151Q2KHN1 245 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q6ZRU5 148 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KMT2AQ03164 3969 aa6.69□□□□□ -1.34
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COX8AP10176 69 aa6.68□□□□□ -1.34
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COX17Q14061 63 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCP2Q8IVA1 136 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C12orf57Q99622 126 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ERG28Q9UKR5 140 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM238C9JI98 176 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PFN2P35080 140 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00158P58513 81 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C10orf25Q5T742 122 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.67□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A0J9YXY3 114 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COPS9Q8WXC6 57 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C14orf144Q96I85 54 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSTD3H0UI37 97 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DLEU1O43261 78 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TIMM17BO60830 172 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLPIP03973 132 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.65□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A0U1RRA0 63 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMIM13P0DJ93 91 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP10-2P60368 255 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GAGE2BQ13066 116 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RYR2Q92736 4967 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C16orf90A8MZG2 172 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GAGE2EQ4V326 116 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.62□□□□□ -1.35
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