RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428450.5

DDX39B-209, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 4

Gene DDX39B, Length 633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-209ENST00000428450 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 OCC1Q8TAD7 63 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 V9GYV3 84 aa6.61□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.6□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 SPAG11BQ08648 103 aa6.6□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 SPATA45Q537H7 98 aa6.6□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 C10orf25Q5T742 122 aa6.6□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.6□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 C5orf38Q86SI9 138 aa6.6□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 BAGE3Q86Y29 109 aa6.6□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.6□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.59□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.59□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 F2Z2F3 143 aa6.59□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 GAGE2EQ4V326 116 aa6.59□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.59□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.59□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.59□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.59□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.59□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 TSHBP01222 138 aa6.58□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.58□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 SMIM12Q96EX1 92 aa6.58□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 I3L3M4 83 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 K7EN84 100 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 C3orf79P0CE67 100 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 MT1HP80294 61 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 Q6ZN92 141 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 ST20Q9HBF5 79 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 F8WDY8 70 aa6.56□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 PMCHP20382 165 aa6.56□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 MRAP2Q96G30 205 aa6.56□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 NDUFA1O15239 70 aa6.55□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.55□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.55□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 BORCS7Q96B45 105 aa6.55□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 CNFNQ9BYD5 112 aa6.55□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.55□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 CFC1BP0CG36 223 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 GNG4P50150 75 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 KRTDAPP60985 99 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 TWIST1Q15672 202 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 K7ERU9 68 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 CT83Q5H943 113 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-209ENST00000428450 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 SSPOA2VEC9 5147 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 A0A1B0GXF2 115 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 TAX1BP3O14907 124 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 BATFQ16520 125 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 CENPWQ5EE01 88 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 CST9LQ9H4G1 147 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 C22orf24Q9Y442 160 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 BCE1O60756 84 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 HSBP1O75506 76 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 SEC11AP67812 179 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 KIAA0087Q14695 138 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 SCGB1A1P11684 91 aa6.48□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 Q6ZUT4 128 aa6.48□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.48□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 USH2AO75445 5202 aa6.48□□□□□ -1.37
DDX39B-209ENST00000428450 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.47□□□□□ -1.37
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