RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-204ENST00000403441 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PRAME-204ENST00000403441 SEC11AP67812 179 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-204ENST00000403441 FA2HQ7L5A8 372 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-204ENST00000403441 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-204ENST00000403441 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-204ENST00000403441 NDUFA1O15239 70 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 LINC00614P0C842 121 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 HERVK_113P63121 156 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 C10orf25Q5T742 122 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.57□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 CST9LQ9H4G1 147 aa7.57□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.57□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.57□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.57□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.57□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 A0A1W2PNN7 141 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 PMVKQ15126 192 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 Q8IZM0 81 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.55□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 HBDP02042 147 aa7.55□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 C1orf137Q5JT78 98 aa7.55□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 RAB5BP61020 215 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 DIRC1Q969H9 104 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 C2orf82Q6UX34 121 aa7.53□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PRAME-204ENST00000403441 IGLC3P0DOY3 106 aa7.52□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 COLCA2A8K830 154 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 IGLV7-43P04211 117 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 PMCHL1Q16048 86 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 ATP5LO75964 103 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 CXCL5P42830 114 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 F8VRH5 84 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 H0Y9J4 135 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 TRGC2P03986 189 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 PRSS2P07478 247 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 LINC00310P59036 64 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 CKS1BP61024 79 aa7.48□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.48□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.47□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.47□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 COX7B2Q8TF08 81 aa7.47□□□□□ -1.21
PRAME-204ENST00000403441 FAM168BA1KXE4 195 aa7.46□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 C11orf86A6NJI1 115 aa7.46□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 H3BRM9 83 aa7.46□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 SPINK8P0C7L1 97 aa7.46□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 UBE2BP63146 152 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 GAGE2EQ4V326 116 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 BAGE3Q86Y29 109 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 LPAP08519 4548 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 M0QXV9 152 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 HSBP1O75506 76 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 SERF1AO75920 110 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 NDUFA6P56556 154 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 PRR4Q16378 134 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.42□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 A0A0U1RQV1 116 aa7.41□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 NUPR1O60356 82 aa7.41□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 TMEM223A0PJW6 202 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 SCO1O75880 301 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-204ENST00000403441 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.39□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.39□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 SFTA2Q6UW10 78 aa7.39□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.39□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 HIST1H2BKO60814 126 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 LEPROTL1O95214 131 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 HIST1H2BJP06899 126 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 HIST1H2BOP23527 126 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 HIST1H2BBP33778 126 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 HIST1H2BDP58876 126 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 HIST1H2BCP62807 126 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 COX17Q14061 63 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-204ENST00000403441 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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