RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 COL6A6A6NMZ7 2263 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 ATMQ13315 3056 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 SORL1Q92673 2214 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 B4DSR2 109 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 F5H768 121 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 TRACP01848 142 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 LINC00694P0DN24 101 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 HTN1P15515 57 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 ATP5J2P56134 94 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 HERVK_113P63121 156 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 HERV-K104P63124 156 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 FAM222AQ5U5X8 452 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 C5orf38Q86SI9 138 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 LINC00643Q86TS7 51 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 UBE2E2Q96LR5 201 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM126AQ9H061 195 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF702PQ9H963 129 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 BSNQ9UPA5 3926 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 A0A096LNT2 108 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 A0A0U1RRA0 63 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 NDUFA7O95182 113 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 CXCL5P42830 114 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 RPL28P46779 137 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 DEFB114Q30KQ6 69 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 C1orf158Q8N1D5 194 aa2.23□□□□□ -2.05
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PTPRK-202ENST00000368205 C3orf22Q8N5N4 141 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 CCL19Q99731 98 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 CSMD1Q96PZ7 3565 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 TTC28Q96AY4 2481 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 SPTA1P02549 2419 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 J3QLI3 93 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 IGKV2D-28P01615 120 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 DEFB136Q30KP8 78 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 LINC00337Q8N6G1 96 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRK-202ENST00000368205 C3orf56Q8N813 242 aa2.22□□□□□ -2.05
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PTPRK-202ENST00000368205 LINC00526Q96FQ7 95 aa2.22□□□□□ -2.05
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PTPRK-202ENST00000368205 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 TRAV25A0A0B4J276 109 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 UQCRQO14949 82 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 INSP01308 110 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 ATP5G1P05496 136 aa2.21□□□□□ -2.06
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PTPRK-202ENST00000368205 CCL18P55774 89 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 AKAP6Q13023 2319 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 Q6ZTI0 123 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 SMIM11BQ8TCY0 68 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 COX7B2Q8TF08 81 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 NRGNQ92686 78 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 Q9HAA7 133 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 XCL2Q9UBD3 114 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 CR1P17927 2039 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 ASPMQ8IZT6 3477 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 NBASA2RRP1 2371 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa2.2□□□□□ -2.06
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PTPRK-202ENST00000368205 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 H0YGX0 51 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 INAFM2P0DMQ5 153 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 C9orf153Q5TBE3 101 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 Q6JHZ5 121 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 C4orf3Q8WVX3 66 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM243Q9BU79 118 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP2.19□□□□□ -2.064e-12■□□□□ 10.1
PTPRK-202ENST00000368205 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 PLAC8L1A1L4L8 177 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 CRPP02741 224 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRK-202ENST00000368205 CRYGAP11844 174 aa2.19□□□□□ -2.06
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