RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 USP17L23D6RBM5 183 aa13.69□□□□□ -0.22
PACSIN3-201ENST00000298838 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC00526Q96FQ7 95 aa13.69□□□□□ -0.22
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM238C9JI98 176 aa13.69□□□□□ -0.22
PACSIN3-201ENST00000298838 MEIG1Q5JSS6 88 aa13.69□□□□□ -0.22
PACSIN3-201ENST00000298838 C6orf223Q8N319 242 aa13.69□□□□□ -0.22
PACSIN3-201ENST00000298838 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
PACSIN3-201ENST00000298838 TIMM17BO60830 172 aa13.67□□□□□ -0.22
PACSIN3-201ENST00000298838 C2orf48Q96LS8 159 aa13.67□□□□□ -0.22
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC00587B1AMM8 73 aa13.66□□□□□ -0.22
PACSIN3-201ENST00000298838 HSD52Q0P140 79 aa13.66□□□□□ -0.22
PACSIN3-201ENST00000298838 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST1H4GQ99525 98 aa13.66□□□□□ -0.22
PACSIN3-201ENST00000298838 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
PACSIN3-201ENST00000298838 LECT2O14960 151 aa13.65□□□□□ -0.22
PACSIN3-201ENST00000298838 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP13.65□□□□□ -0.22
PACSIN3-201ENST00000298838 CAMK2N2Q96S95 79 aa13.65□□□□□ -0.22
PACSIN3-201ENST00000298838 LITAFQ99732 161 aa13.65□□□□□ -0.22
PACSIN3-201ENST00000298838 F8WDY8 70 aa13.64□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 TAL2Q16559 108 aa13.64□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa13.64□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 ERG28Q9UKR5 140 aa13.64□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 ALMS1Q8TCU4 4167 aa13.64□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 SMIM13P0DJ93 91 aa13.62□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa13.62□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 C10orf25Q5T742 122 aa13.62□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 KMT2AQ03164 3969 aa13.62□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A0U1RRA0 63 aa13.62□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 WFDC2Q14508 124 aa13.61□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 Q6ZVH6 145 aa13.61□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 SPANXDQ9BXN6 97 aa13.61□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 SPANXCQ9NY87 97 aa13.61□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 PFN2P35080 140 aa13.6□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 C1orf134Q5TEV5 83 aa13.6□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa13.6□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 M0R143 59 aa13.6□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 GCSHP23434 173 aa13.6□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC00158P58513 81 aa13.6□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 COX17Q14061 63 aa13.6□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 C14orf177Q52M58 125 aa13.6□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 DAND5Q8N907 189 aa13.6□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 C6orf48Q9UBA6 75 aa13.6□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAH10Q8IVF4 4471 aa13.59□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 SYCNQ0VAF6 134 aa13.59□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 Q6ZRU5 148 aa13.59□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 CEND1Q8N111 149 aa13.59□□□□□ -0.23
PACSIN3-201ENST00000298838 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PACSIN3-201ENST00000298838 LRCOL1A6NCL2 159 aa13.57□□□□□ -0.24
PACSIN3-201ENST00000298838 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa13.57□□□□□ -0.24
PACSIN3-201ENST00000298838 BATFQ16520 125 aa13.56□□□□□ -0.24
PACSIN3-201ENST00000298838 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa13.56□□□□□ -0.24
PACSIN3-201ENST00000298838 CARD19Q96LW7 228 aa13.56□□□□□ -0.24
PACSIN3-201ENST00000298838 IFITM1P13164 125 aa13.55□□□□□ -0.24
PACSIN3-201ENST00000298838 COPS9Q8WXC6 57 aa13.55□□□□□ -0.24
PACSIN3-201ENST00000298838 SNHG12Q9BXW3 62 aa13.55□□□□□ -0.24
PACSIN3-201ENST00000298838 LCE6AA0A183 80 aa13.54□□□□□ -0.24
PACSIN3-201ENST00000298838 SLPIP03973 132 aa13.54□□□□□ -0.24
PACSIN3-201ENST00000298838 NPC2P61916 151 aa13.54□□□□□ -0.24
PACSIN3-201ENST00000298838 MUSTN1Q8IVN3 82 aa13.54□□□□□ -0.24
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAH6Q9C0G6 4158 aa13.54□□□□□ -0.24
PACSIN3-201ENST00000298838 PTTG1IPP53801 180 aa13.53□□□□□ -0.24
PACSIN3-201ENST00000298838 FXYD2P54710 66 aa13.53□□□□□ -0.24
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC00308Q8TCZ7 52 aa13.53□□□□□ -0.24
PACSIN3-201ENST00000298838 EREGO14944 169 aa13.52□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 RPL24P83731 157 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF151Q2KHN1 245 aa13.51□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa13.5□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 A6NJY4 79 aa13.5□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 CNBPP62633 177 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A087WTM6 91 aa13.5□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 PPDPFQ9H3Y8 114 aa13.49□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa13.48□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa13.48□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 Q8N814 137 aa13.48□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa13.48□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 A4D1N5 150 aa13.47□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 A6NDN8 102 aa13.46□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAH2Q9P225 4427 aa13.46□□□□□ -0.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TLX1NBP0CAT3 122 aa13.45□□□□□ -0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa13.43□□□□□ -0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 ARL17AQ8IVW1 177 aa13.43□□□□□ -0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 RTL8CO15255 209 aa13.43□□□□□ -0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 Q6ZRP5 223 aa13.43□□□□□ -0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa13.42□□□□□ -0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 GAGE2EQ4V326 116 aa13.41□□□□□ -0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 XAGE1AQ9HD64 81 aa13.41□□□□□ -0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 GAGE2DQ9UEU5 116 aa13.41□□□□□ -0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa13.41□□□□□ -0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 TNP2Q05952 138 aa13.41□□□□□ -0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 HYDINQ4G0P3 5121 aa13.41□□□□□ -0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 SACSQ9NZJ4 4579 aa13.4□□□□□ -0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1B0GWB2 263 aa13.4□□□□□ -0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PACSIN3-201ENST00000298838 K7ERJ3 54 aa13.39□□□□□ -0.27
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