RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAPPC10-201ENST00000291574 F8P00451 2351 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAPPC10-201ENST00000291574 DNAH12Q6ZR08 3092 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAPPC10-201ENST00000291574 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q6ZSN1 163 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.78□□□□□ -0.84
TRAPPC10-201ENST00000291574 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q8N3U1 123 aa9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 C1orf195Q5TG92 126 aa9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 POLQO75417 2590 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 LRP4O75096 1905 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF843Q8N446 348 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A1W2PPR1 153 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC00846Q9NV44 126 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 PRO3102Q9H379 93 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q8N9L7 120 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 SERP1Q9Y6X1 66 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 A8MTW9 85 aa9.73□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa9.72□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9.72□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC00208Q96KT6 92 aa9.72□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.72□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TRAPPC10-201ENST00000291574 C1orf137Q5JT78 98 aa9.71□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.71□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 FHL2Q14192 279 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 C6orf223Q8N319 242 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 MUC7Q8TAX7 377 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 ADAMTS20P59510 1910 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 PLA2G2AP14555 144 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC00575Q6W349 94 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 ACANP16112 2415 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 PRYO14603 147 aa9.67□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 BEAN1Q3B7T3 259 aa9.67□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 M0R2N4 97 aa9.67□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 LY6G6DO95868 133 aa9.67□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q6ZVQ6 151 aa9.67□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q8N2B8 174 aa9.67□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 UTRNP46939 3433 aa9.66□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 PRO0461Q9UI25 63 aa9.66□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 PMAIP1Q13794 54 aa9.66□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 PSPHP1O15172 72 aa9.66□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP10-9P60411 292 aa9.66□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.65□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGLV1-51P01701 117 aa9.65□□□□□ -0.86
TRAPPC10-201ENST00000291574 PRR15LQ9BU68 103 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 PTPRBP23467 1997 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM254Q8TBM7 123 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC00315P59091 139 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 DEFB116Q30KQ4 102 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 RETNQ9HD89 108 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 SMR3AQ99954 134 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 K7ERS5 55 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC01546A6NGU7 62 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 BRI3O95415 125 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A087WSZ3 146 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q9UF83 564 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.59□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 IL17DQ8TAD2 202 aa9.59□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 PCOTHQ58A44 107 aa9.59□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 C10orf25Q5T742 122 aa9.59□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 ESRGQ1W209 222 aa9.59□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A1B0GUV1 79 aa9.59□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q6ZTC4 211 aa9.59□□□□□ -0.87
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM218AQ96MZ4 157 aa9.57□□□□□ -0.88
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa9.57□□□□□ -0.88
TRAPPC10-201ENST00000291574 REG3GQ6UW15 175 aa9.57□□□□□ -0.88
TRAPPC10-201ENST00000291574 C7orf33Q8WU49 177 aa9.57□□□□□ -0.88
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC10-201ENST00000291574 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.56□□□□□ -0.88
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q6ZRU5 148 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC10-201ENST00000291574 CRYGAP11844 174 aa9.53□□□□□ -0.88
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q9BRP9 147 aa9.52□□□□□ -0.88
TRAPPC10-201ENST00000291574 H0Y9P7 68 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC10-201ENST00000291574 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC10-201ENST00000291574 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A0C4DFX4 3053 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC10-201ENST00000291574 CXCL6P80162 114 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC10-201ENST00000291574 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC10-201ENST00000291574 USP24Q9UPU5 2620 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC10-201ENST00000291574 PRLHP81277 87 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC10-201ENST00000291574 C4orf26Q17RF5 130 aa9.49□□□□□ -0.89
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