RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 KLLNB2CW77 178 aa8.48□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00208Q96KT6 92 aa8.48□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 PTPRSQ13332 1948 aa8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM229AH3BQW9 127 aa8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF580Q9UK33 172 aa8.47□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 EP400Q96L91 3159 aa8.46□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A087WYN8 130 aa8.46□□□□□ -1.05
UBASH3B-201ENST00000284273 Q8IZM0 81 aa8.46□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 Q9UF83 564 aa8.46□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A087WSZ3 146 aa8.45□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.45□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.45□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 Q6ZRU5 148 aa8.45□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 COX17Q14061 63 aa8.44□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 C16orf95Q9H693 158 aa8.43□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.43□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 LRP4O75096 1905 aa8.43□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.43□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.43□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 MOBPQ13875 183 aa8.42□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.42□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.41□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 CACNA1AO00555 2505 aa8.41□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.41□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.4□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 FSTL3O95633 263 aa8.4□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00575Q6W349 94 aa8.4□□□□□ -1.06
UBASH3B-201ENST00000284273 HCG22E2RYF7 251 aa8.4□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 C22orf24Q9Y442 160 aa8.39□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.39□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 Q8N814 137 aa8.39□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.39□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 Q8N3U1 123 aa8.39□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 IGF2RP11717 2491 aa8.39□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.38□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A087WVE0 104 aa8.38□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 CRYGAP11844 174 aa8.38□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.38□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.37□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.37□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.37□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 RTL8CO15255 209 aa8.36□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.36□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 H0Y9P7 68 aa8.36□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 LIMD2Q9BT23 127 aa8.35□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.35□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.35□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 PSPHP1O15172 72 aa8.34□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRK2Q5S007 2527 aa8.34□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.34□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 UQCRQO14949 82 aa8.34□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.34□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.34□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00315P59091 139 aa8.34□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 NAV2Q8IVL1 2488 aa8.34□□□□□ -1.07
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.32□□□□□ -1.08
UBASH3B-201ENST00000284273 MUC7Q8TAX7 377 aa8.32□□□□□ -1.08
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC179H3BU77 68 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-201ENST00000284273 IGIPA6NJ69 53 aa8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-201ENST00000284273 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
UBASH3B-201ENST00000284273 KIAA0087Q14695 138 aa8.29□□□□□ -1.08
UBASH3B-201ENST00000284273 JMJD1CQ15652 2540 aa8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-201ENST00000284273 hDV103S1A0JD37 113 aa8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-201ENST00000284273 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-201ENST00000284273 Q96NJ1 140 aa8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-201ENST00000284273 CENPFP49454 3210 aa8.28□□□□□ -1.08
UBASH3B-201ENST00000284273 C9orf92A6NGG3 77 aa8.26□□□□□ -1.09
UBASH3B-201ENST00000284273 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
UBASH3B-201ENST00000284273 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.26□□□□□ -1.09
UBASH3B-201ENST00000284273 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
UBASH3B-201ENST00000284273 UTRNP46939 3433 aa8.26□□□□□ -1.09
UBASH3B-201ENST00000284273 V9GYY9 64 aa8.26□□□□□ -1.09
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00167Q96N53 147 aa8.25□□□□□ -1.09
UBASH3B-201ENST00000284273 Q6JHZ5 121 aa8.25□□□□□ -1.09
UBASH3B-201ENST00000284273 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.25□□□□□ -1.09
UBASH3B-201ENST00000284273 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.23□□□□□ -1.09
UBASH3B-201ENST00000284273 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.22□□□□□ -1.09
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM168BA1KXE4 195 aa8.22□□□□□ -1.09
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.22□□□□□ -1.09
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.21□□□□□ -1.09
UBASH3B-201ENST00000284273 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.21□□□□□ -1.1
UBASH3B-201ENST00000284273 C2CD3Q4AC94 2353 aa8.21□□□□□ -1.1
UBASH3B-201ENST00000284273 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
UBASH3B-201ENST00000284273 SMIM29Q86T20 159 aa8.2□□□□□ -1.1
UBASH3B-201ENST00000284273 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.2□□□□□ -1.1
UBASH3B-201ENST00000284273 NDUFC1O43677 76 aa8.2□□□□□ -1.1
UBASH3B-201ENST00000284273 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.2□□□□□ -1.1
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-201ENST00000284273 PMAIP1Q13794 54 aa8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00313P59037 77 aa8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-201ENST00000284273 PTPRBP23467 1997 aa8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-201ENST00000284273 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1B0GUV1 79 aa8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms