RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A087WWL8 130 aa8.89□□□□□ -0.99
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RABGEF1-209ENST00000607882 DEFB130AP0DP74 79 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-209ENST00000607882 MED14OSP0DP75 135 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-209ENST00000607882 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-209ENST00000607882 F8W1H4 67 aa8.88□□□□□ -0.99
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RABGEF1-209ENST00000607882 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
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RABGEF1-209ENST00000607882 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.88□□□□□ -0.99
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RABGEF1-209ENST00000607882 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.87□□□□□ -0.997e-6■□□□□ 11.1
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RABGEF1-209ENST00000607882 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-209ENST00000607882 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.87□□□□□ -0.99
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RABGEF1-209ENST00000607882 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-209ENST00000607882 HERVK_113P61574 105 aa8.83□□□□□ -1
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RABGEF1-209ENST00000607882 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.82□□□□□ -1
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RABGEF1-209ENST00000607882 Q9UF83 564 aa8.82□□□□□ -1
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RABGEF1-209ENST00000607882 M0R2N4 97 aa8.77□□□□□ -1
RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV3-30P01768 117 aa8.77□□□□□ -1
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RABGEF1-209ENST00000607882 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 AMELXQ99217 191 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.77□□□□□ -1.01
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