RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596756.5

IRF3-212, Transcript of interferon regulatory factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene IRF3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3-212ENST00000596756 LINC01546A6NGU7 62 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF3-212ENST00000596756 RAB5AP20339 215 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF3-212ENST00000596756 FCER1GP30273 86 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF3-212ENST00000596756 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
IRF3-212ENST00000596756 C7orf33Q8WU49 177 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF3-212ENST00000596756 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 TRGC2P03986 189 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 MAJINQ3KP22 176 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 FAM104AQ969W3 186 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 A0A096LNI7 61 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 STPG4Q8N801 248 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 K7EMI3 77 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 XCL1P47992 114 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 LINC01600Q96MT4 127 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 CCL25O15444 150 aa8.48□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 LINC00614P0C842 121 aa8.48□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.48□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 TMEM101Q96IK0 257 aa8.48□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.47□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.47□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.47□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 TMEM18Q96B42 140 aa8.47□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.47□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.47□□□□□ -1.05
IRF3-212ENST00000596756 IGIPA6NJ69 53 aa8.46□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 CARD19Q96LW7 228 aa8.46□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.45□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.45□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 FA2HQ7L5A8 372 aa8.45□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 TOMM6Q96B49 74 aa8.45□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.45□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 A0A096LNJ9 63 aa8.44□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 SS18Q15532 418 aa8.44□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.44□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.44□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 A0A0J9YXV3 536 aa8.43□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 G0S2P27469 103 aa8.43□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 LINC00310P59036 64 aa8.43□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 RAB5BP61020 215 aa8.43□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 SYCNQ0VAF6 134 aa8.43□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.43□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 ODF1Q14990 250 aa8.43□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.43□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.42□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.42□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 NUPR1O60356 82 aa8.42□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 KRTAP10-8P60410 259 aa8.42□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 Q6ZUT4 128 aa8.42□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 HIST1H2BKO60814 126 aa8.41□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 HIST1H2BJP06899 126 aa8.41□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 HIST1H2BOP23527 126 aa8.41□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 HIST1H2BBP33778 126 aa8.41□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 PTTG1IPP53801 180 aa8.41□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 HIST1H2BDP58876 126 aa8.41□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 HIST1H2BCP62807 126 aa8.41□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.41□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 Q6ZRP5 223 aa8.41□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 ERASQ7Z444 233 aa8.41□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.41□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 AMELXQ99217 191 aa8.41□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.41□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.41□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.4□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 NPSP0C0P6 89 aa8.4□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 PMCHL1Q16048 86 aa8.4□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.4□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.4□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 BAGE3Q86Y29 109 aa8.4□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 TIMM17AQ99595 171 aa8.4□□□□□ -1.06
IRF3-212ENST00000596756 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.39□□□□□ -1.07
IRF3-212ENST00000596756 COX7A2LO14548 114 aa8.39□□□□□ -1.07
IRF3-212ENST00000596756 REG3GQ6UW15 175 aa8.39□□□□□ -1.07
IRF3-212ENST00000596756 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.39□□□□□ -1.07
IRF3-212ENST00000596756 TMEM141Q96I45 108 aa8.39□□□□□ -1.07
IRF3-212ENST00000596756 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.39□□□□□ -1.07
IRF3-212ENST00000596756 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.38□□□□□ -1.07
IRF3-212ENST00000596756 A0A1W2PNN7 141 aa8.38□□□□□ -1.07
IRF3-212ENST00000596756 LINC01549A6NIU2 74 aa8.38□□□□□ -1.07
IRF3-212ENST00000596756 SERF1AO75920 110 aa8.38□□□□□ -1.07
IRF3-212ENST00000596756 MALP21145 153 aa8.38□□□□□ -1.07
IRF3-212ENST00000596756 GAGE2BQ13066 116 aa8.38□□□□□ -1.07
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