RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.63□□□□□ -0.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 F5H768 121 aa11.62□□□□□ -0.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SMIM9A6NGZ8 99 aa11.61□□□□□ -0.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 X6R8D5 127 aa11.61□□□□□ -0.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa11.6□□□□□ -0.55
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 Q9H8V8 135 aa11.6□□□□□ -0.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa11.6□□□□□ -0.55
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 H3BT86 120 aa11.4□□□□□ -0.58
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa11.4□□□□□ -0.58
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDIP1Q9H305 208 aa11.4□□□□□ -0.58
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COX7A2LO14548 114 aa11.39□□□□□ -0.59
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CELA1Q9UNI1 258 aa11.39□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SCGB1A1P11684 91 aa11.39□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.38□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa11.38□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 F8P00451 2351 aa11.38□□□□□ -0.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa11.37□□□□□ -0.59
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