RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.19□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.19□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 A0A0J9YXV3 536 aa8.19□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 SIVA1O15304 175 aa8.19□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 CCL25O15444 150 aa8.19□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 HTN3P15516 51 aa8.19□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.19□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 LINC00587B1AMM8 73 aa8.18□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 GAGE6Q13070 117 aa8.18□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.18□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.18□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.17□□□□□ -1.1
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GGA3-217ENST00000583667 HERVK_113P61574 105 aa8.17□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 HERVK_113P63121 156 aa8.17□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 Q8N1X5 172 aa8.17□□□□□ -1.1
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GGA3-217ENST00000583667 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.16□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.16□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.15□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 RTL8CO15255 209 aa8.15□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 CDK2AP2O75956 126 aa8.15□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.15□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 HIGD1BQ9P298 99 aa8.15□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 LEPROTO15243 131 aa8.14□□□□□ -1.11
GGA3-217ENST00000583667 NMUP48645 174 aa8.14□□□□□ -1.11
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GGA3-217ENST00000583667 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
GGA3-217ENST00000583667 PCP2Q8IVA1 136 aa8.14□□□□□ -1.11
GGA3-217ENST00000583667 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
GGA3-217ENST00000583667 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.13□□□□□ -1.11
GGA3-217ENST00000583667 TMEM262E9PQX1 116 aa8.13□□□□□ -1.11
GGA3-217ENST00000583667 H3BRM9 83 aa8.13□□□□□ -1.11
GGA3-217ENST00000583667 MPV17L2Q567V2 206 aa8.13□□□□□ -1.11
GGA3-217ENST00000583667 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.13□□□□□ -1.11
GGA3-217ENST00000583667 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.13□□□□□ -1.11
GGA3-217ENST00000583667 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.13□□□□□ -1.11
GGA3-217ENST00000583667 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.12□□□□□ -1.11
GGA3-217ENST00000583667 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.12□□□□□ -1.11
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GGA3-217ENST00000583667 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.11□□□□□ -1.11
GGA3-217ENST00000583667 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.11□□□□□ -1.11
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GGA3-217ENST00000583667 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.11□□□□□ -1.11
GGA3-217ENST00000583667 PRR34Q9NV39 138 aa8.11□□□□□ -1.11
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GGA3-217ENST00000583667 TAL2Q16559 108 aa8.08□□□□□ -1.12
GGA3-217ENST00000583667 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.08□□□□□ -1.12
GGA3-217ENST00000583667 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.07□□□□□ -1.12
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GGA3-217ENST00000583667 HSD52Q0P140 79 aa8.07□□□□□ -1.12
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GGA3-217ENST00000583667 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.07□□□□□ -1.12
GGA3-217ENST00000583667 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.07□□□□□ -1.12
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GGA3-217ENST00000583667 APLNQ9ULZ1 77 aa8.06□□□□□ -1.12
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GGA3-217ENST00000583667 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.05□□□□□ -1.12
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GGA3-217ENST00000583667 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-217ENST00000583667 MYCBP2O75592 4640 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-217ENST00000583667 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-217ENST00000583667 K7EP13 123 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-217ENST00000583667 CCL18P55774 89 aa8.04□□□□□ -1.12
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GGA3-217ENST00000583667 ENHOQ6UWT2 76 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-217ENST00000583667 C16orf90A8MZG2 172 aa8.03□□□□□ -1.12
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GGA3-217ENST00000583667 M0R2N4 97 aa8.03□□□□□ -1.12
GGA3-217ENST00000583667 NDUFA1O15239 70 aa8.03□□□□□ -1.12
GGA3-217ENST00000583667 TIMM17BO60830 172 aa8.03□□□□□ -1.12
GGA3-217ENST00000583667 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.03□□□□□ -1.12
GGA3-217ENST00000583667 MIAQ16674 131 aa8.03□□□□□ -1.12
GGA3-217ENST00000583667 SFTA2Q6UW10 78 aa8.03□□□□□ -1.12
GGA3-217ENST00000583667 Q8N3U1 123 aa8.03□□□□□ -1.12
GGA3-217ENST00000583667 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
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