RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 PP632Q6XCG6 107 aa2.97□□□□□ -1.93
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TSG101-211ENST00000580814 KLK9Q9UKQ9 250 aa2.97□□□□□ -1.93
TSG101-211ENST00000580814 NESP48681 1621 aa2.97□□□□□ -1.93
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TSG101-211ENST00000580814 A0A1W2PNN7 141 aa2.93□□□□□ -1.94
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TSG101-211ENST00000580814 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
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TSG101-211ENST00000580814 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
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TSG101-211ENST00000580814 LINC00208Q96KT6 92 aa2.87□□□□□ -1.95
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TSG101-211ENST00000580814 COL4A2P08572 1712 aa2.87□□□□□ -1.95
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TSG101-211ENST00000580814 LINC00846Q9NV44 126 aa2.86□□□□□ -1.95
TSG101-211ENST00000580814 ZNF236Q9UL36 1845 aa2.86□□□□□ -1.95
TSG101-211ENST00000580814 KIAA0556O60303 1618 aa2.86□□□□□ -1.95
TSG101-211ENST00000580814 PKD1L3Q7Z443 1732 aa2.85□□□□□ -1.95
TSG101-211ENST00000580814 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa2.85□□□□□ -1.95
TSG101-211ENST00000580814 H0Y9P7 68 aa2.85□□□□□ -1.95
TSG101-211ENST00000580814 SPINK7P58062 85 aa2.85□□□□□ -1.95
TSG101-211ENST00000580814 SPRR4Q96PI1 79 aa2.85□□□□□ -1.95
TSG101-211ENST00000580814 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
TSG101-211ENST00000580814 MYO7BQ6PIF6 2116 aa2.84□□□□□ -1.95
TSG101-211ENST00000580814 TRGV2A0A075B6R0 118 aa2.84□□□□□ -1.95
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