RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.39□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 ST20Q9HBF5 79 aa9.39□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 PRSS1P07477 247 aa9.38□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 PET117Q6UWS5 81 aa9.38□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.37□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 VCYO14598 125 aa9.37□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 ORMDL2Q53FV1 153 aa9.37□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.37□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.37□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 MYCBP2O75592 4640 aa9.36□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.36□□□□□ -0.91
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CMTM3-215ENST00000568477 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.36□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.36□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 C20orf202A1L168 122 aa9.35□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.35□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.34□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 LINC01549A6NIU2 74 aa9.34□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 H7C423 109 aa9.34□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 TCAPO15273 167 aa9.34□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.34□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 hDV102S1A0JD36 115 aa9.33□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 I3L3M4 83 aa9.33□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 ATP5LO75964 103 aa9.33□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 LINC01545Q5VT33 79 aa9.33□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.33□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 KIR2DL4Q99706 377 aa9.33□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 HERC1Q15751 4861 aa9.33□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.32□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 FGF6P10767 208 aa9.32□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.32□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 VAMP8Q9BV40 100 aa9.32□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 GAGE12HA6NDE8 117 aa9.31□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 PCP4L1A6NKN8 68 aa9.31□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 TSTD3H0UI37 97 aa9.31□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 TOMM6Q96B49 74 aa9.31□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 TSHBP01222 138 aa9.29□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 CFAP161Q6P656 301 aa9.29□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.29□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM101Q96IK0 257 aa9.29□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.28□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.28□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CMTM3-215ENST00000568477 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.27□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 ERASQ7Z444 233 aa9.27□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 C15orf56Q8N910 161 aa9.27□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.27□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.27□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 PRO1933Q9H354 126 aa9.27□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 H0Y8G0 127 aa9.26□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 J3QL48 77 aa9.26□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.26□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.25□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 PANO1I0J062 215 aa9.25□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 SLPIP03973 132 aa9.25□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 SPATA45Q537H7 98 aa9.25□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 Q6ZN92 141 aa9.25□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 ATOH7Q8N100 152 aa9.25□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM141Q96I45 108 aa9.25□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.24□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 DDTP30046 118 aa9.24□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 XCL1P47992 114 aa9.24□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 FOXI1Q12951 378 aa9.24□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 ODF1Q14990 250 aa9.24□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.24□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 TIMM17AQ99595 171 aa9.24□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.23□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 IGIPA6NJ69 53 aa9.23□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 CCL25O15444 150 aa9.23□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.23□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.22□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 SS18Q15532 418 aa9.22□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 DPH3Q96FX2 82 aa9.22□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.22□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.22□□□□□ -0.93
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00587B1AMM8 73 aa9.21□□□□□ -0.94
CMTM3-215ENST00000568477 DPM2O94777 84 aa9.21□□□□□ -0.94
CMTM3-215ENST00000568477 NPSP0C0P6 89 aa9.21□□□□□ -0.94
CMTM3-215ENST00000568477 CHTF8P0CG12 524 aa9.21□□□□□ -0.94
CMTM3-215ENST00000568477 IGLC3P0DOY3 106 aa9.21□□□□□ -0.94
CMTM3-215ENST00000568477 MAJINQ3KP22 176 aa9.21□□□□□ -0.94
CMTM3-215ENST00000568477 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.2□□□□□ -0.94
CMTM3-215ENST00000568477 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CMTM3-215ENST00000568477 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.2□□□□□ -0.94
CMTM3-215ENST00000568477 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.2□□□□□ -0.94
CMTM3-215ENST00000568477 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.2□□□□□ -0.94
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