RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 MT-ND6P03923 174 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGLV7-43P04211 117 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMIM17P0DL12 118 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 AKR1C3P42330 323 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 C1orf137Q5JT78 98 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 RASL11AQ6T310 242 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBE2L6O14933 153 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 MGPP08493 103 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 COTL1Q14019 142 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 BCL2P10415 239 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 NTF3P20783 257 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 XCL1P47992 114 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 SYCNQ0VAF6 134 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q5BKY6 102 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 AKAP14Q86UN6 197 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 NIT2Q9NQR4 276 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-AS1-204ENST00000559861 APOMO95445 188 aa4.9□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q6ZVH6 145 aa4.9□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 NUP35Q8NFH5 326 aa4.9□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.9□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.89□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCL25O15444 150 aa4.89□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 NCR2O95944 276 aa4.89□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 FGF6P10767 208 aa4.89□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 CTRLP40313 264 aa4.89□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 STOML3Q8TAV4 291 aa4.89□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00167Q96N53 147 aa4.89□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 CNFNQ9BYD5 112 aa4.89□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.88□□□□□ -1.63
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USP3-AS1-204ENST00000559861 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 C19orf71A6NCJ1 209 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 G3V3Q6 166 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 APCSP02743 223 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 GIPP09681 153 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRGC1P0CF51 173 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 BAGE2Q86Y30 109 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 TCTE3Q8IZS6 198 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 GATD1Q8NB37 220 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 ISOC2Q96AB3 205 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa4.86□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 ESDP10768 282 aa4.86□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBE2D1P51668 147 aa4.86□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.86□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 TPPP3Q9BW30 176 aa4.86□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa4.85□□□□□ -1.63
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USP3-AS1-204ENST00000559861 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 TPRXLQ17RH7 258 aa4.85□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa4.85□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSKUQ8WUA8 353 aa4.85□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa4.84□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.84□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 F2Z2F3 143 aa4.84□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPS20P60866 119 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 CENPWQ5EE01 88 aa4.84□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR2D3Q8NGH3 330 aa4.84□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.84□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.84□□□□□ -1.63
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa4.83□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.83□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.83□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.83□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 C9orf62Q8N4C0 152 aa4.83□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMIM12Q96EX1 92 aa4.83□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYTL1Q9NRR1 136 aa4.83□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 COX7A2LO14548 114 aa4.82□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARPC5O15511 151 aa4.82□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF861PO60384 105 aa4.82□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPAG11BQ08648 103 aa4.82□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 SS18Q15532 418 aa4.82□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 MBD3L1Q8WWY6 194 aa4.82□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 BTF3L4Q96K17 158 aa4.82□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 HMSDA8MTL9 139 aa4.81□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 I3L3M4 83 aa4.81□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 M0QXV9 152 aa4.81□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSPAN13O95857 204 aa4.81□□□□□ -1.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
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