RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 GATD1Q8NB37 220 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 MANBALQ9NQG1 85 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 IGLC6P0CF74 106 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 CTRLP40313 264 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 UBE2AP49459 152 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 PEA15Q15121 130 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 DAND5Q8N907 189 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 FAM210AQ96ND0 272 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 GNG13Q9P2W3 67 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 C7orf77A4D0Y5 90 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 TWIST1Q15672 202 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 C10orf25Q5T742 122 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 C22orf24Q9Y442 160 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 PDE6DO43924 150 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 S100A1P23297 94 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 COMMD7Q86VX2 200 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM250H0YL14 139 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 FCER1GP30273 86 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.44□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 KIR2DL4Q99706 377 aa5.43□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 SEC11CQ9BY50 192 aa5.43□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 ST20Q9HBF5 79 aa5.43□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM218A2RU14 115 aa5.42□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 RPL35P42766 123 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 CEBPGP53567 150 aa5.42□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.42□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 C10orf91Q5T1B1 145 aa5.42□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.42□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa5.42□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 TNFRSF6BO95407 300 aa5.41□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.41□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 C11orf52Q96A22 123 aa5.41□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM18Q96B42 140 aa5.41□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 SMIM12Q96EX1 92 aa5.41□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.41□□□□□ -1.54
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SMAD3-211ENST00000559460 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.4□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF727A8MUV8 499 aa5.4□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 CENPWQ5EE01 88 aa5.4□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 XP32Q5T750 250 aa5.4□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 Q6ZUT4 128 aa5.4□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.4□□□□□ -1.54
SMAD3-211ENST00000559460 GNG4P50150 75 aa5.39□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.39□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.39□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 BIN3Q9NQY0 253 aa5.39□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 F8W036 122 aa5.38□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 ATP6V1G1O75348 118 aa5.38□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 C2orf82Q6UX34 121 aa5.38□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 SVBPQ8N300 66 aa5.38□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 OCC1Q8TAD7 63 aa5.38□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.37□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 GAGE10A6NGK3 116 aa5.37□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 SNAPINO95295 136 aa5.37□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 PRSS2P07478 247 aa5.37□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 CKS1BP61024 79 aa5.37□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.37□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 NAT8Q9UHE5 227 aa5.37□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa5.36□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.36□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 IFITM10A6NMD0 228 aa5.36□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 C9JQL5 133 aa5.36□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 SPINK1P00995 79 aa5.36□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.36□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 NUDT11Q96G61 164 aa5.36□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00167Q96N53 147 aa5.36□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 CNFNQ9BYD5 112 aa5.36□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 K7EN84 100 aa5.35□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 VCYO14598 125 aa5.35□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 HBBP68871 147 aa5.35□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 RHEBQ15382 184 aa5.35□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 PCOTHQ58A44 107 aa5.35□□□□□ -1.55
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.35□□□□□ -1.55
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