RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557114.5

CCNB1IP1-215, Transcript of cyclin B1 interacting protein 1, human

TSL 5

Gene CCNB1IP1, Length 756 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114		H7C1H1	209 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	NPY	P01303	97 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	MGP	P08493	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	CKS2	P33552	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	ZNF56	Q15929	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114		K7EMI3	77 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	ESD	P10768	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	RHOH	Q15669	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	RMI2	Q96E14	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114		A0A1B0GUV1	79 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	NCR2	O95944	276 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114		A0A087WYN8	130 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	TCAP	O15273	167 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	PRSS1	P07477	247 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	GAGE5	Q13069	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	GAGE6	Q13070	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114		Q8N8P6	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	LINC00614	P0C842	121 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	PMCH	P20382	165 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	UBE2D3	P61077	147 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	UBE2D2	P62837	147 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114		Q9UF83	564 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114		I3L3M4	83 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	SERF1A	O75920	110 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	NDUFA6	P56556	154 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	NIT1	Q86X76	327 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114		A0A096LNJ9	63 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	NUPR1	O60356	82 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	TSHB	P01222	138 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	S100A6	P06703	90 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	PRR4	Q16378	134 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	HSBP1	O75506	76 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	G0S2	P27469	103 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	FCER1G	P30273	86 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114		H7C423	109 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	HBD	P02042	147 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	COTL1	Q14019	142 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.48	□□□□□ -1.69

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