RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 CRYGDP07320 174 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 HIST1H4GQ99525 98 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 LYRM9A8MSI8 78 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 K7EQD1 137 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 ASIPP42127 132 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 C6orf223Q8N319 242 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 M0QXV9 152 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 FHL2Q14192 279 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 AMN1Q8IY45 258 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 BAALCQ8WXS3 180 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 PRO0255Q9UI72 69 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 A0A087WX48 190 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 NPYP01303 97 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 GAGE2BQ13066 116 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 GAGE2EQ4V326 116 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 PRSS1P07477 247 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 UBE2D3P61077 147 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 UBE2D2P62837 147 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 A8MWV9 139 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 CCDC179H3BU77 68 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 K7EMI3 77 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 CKS2P33552 79 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.15□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.15□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 KLLNB2CW77 178 aa5.15□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 CRIP1P50238 77 aa5.15□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
CS-212ENST00000548567 SH2D1AO60880 128 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 IFITM1P13164 125 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 PSMB2P49721 201 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 TTC32Q5I0X7 151 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 TMEM126AQ9H061 195 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 SNCGO76070 127 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 UBE2D1P51668 147 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 PLNP26678 52 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 LYPD1Q8N2G4 141 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 PTH2Q96A98 100 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 KIR2DL4Q99706 377 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 LINC01549A6NIU2 74 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 SMKR1H3BMG3 65 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 Q8N8P6 123 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 M0R2P5 195 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 RNF185Q96GF1 192 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 SPXQ9BT56 116 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 PDE6HQ13956 83 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 LINC01600Q96MT4 127 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 TNFRSF6BO95407 300 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 TCL1BO95988 128 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 IGLC6P0CF74 106 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 C5orf47Q569G3 176 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 F8VRH5 84 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 H7C1H1 209 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 CNFNQ9BYD5 112 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.1□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 RASL10AQ92737 203 aa5.1□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.1□□□□□ -1.59
CS-212ENST00000548567 GAS8-AS1O95177 125 aa5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 122.6 ms