RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 Q5VSD8 79 aa-0.25□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 Q8IZM0 81 aa-0.25□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 SMIM4Q8WVI0 70 aa-0.25□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 LENEPQ9Y5L5 61 aa-0.25□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 SERP1Q9Y6X1 66 aa-0.25□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 ZNF236Q9UL36 1845 aa-0.25□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 ALMS1Q8TCU4 4167 aa-0.25□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 RELNP78509 3460 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 CSMD2Q7Z408 3487 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 LOC400499M0QZD8 3231 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 DOCK2Q92608 1830 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 LRRC37A2A6NM11 1700 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 PHLPP1O60346 1717 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 FAM25AB3EWG3 89 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 FAM25CB3EWG5 89 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 FAM25GB3EWG6 89 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 SPRR1AP35321 89 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 C12orf73Q69YU5 71 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 Q6AWC8 147 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 COPS9Q8WXC6 57 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 ARL11Q969Q4 196 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 LINC00470Q9BZP3 86 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 RERGLQ9H628 205 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 V9GYH0 126 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 LRBAP50851 2863 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 LPAP08519 4548 aa-0.26□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 FREM2Q5SZK8 3169 aa-0.27□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-0.27□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-0.27□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 ZFHX3Q15911 3703 aa-0.27□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 ERCC6L2Q5T890 1561 aa-0.27□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 NDUFA2O43678 99 aa-0.27□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 PI4KAP42356 2102 aa-0.27□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 SELENOWP63302 87 aa-0.27□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 CCDC58Q4VC31 144 aa-0.27□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 MEIG1Q5JSS6 88 aa-0.27□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 SPRR2FQ96RM1 72 aa-0.27□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 AMELXQ99217 191 aa-0.27□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 FOCADQ5VW36 1801 aa-0.27□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 C5orf42Q9H799 3197 aa-0.27□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 MGAQ8IWI9 3026 aa-0.27□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-0.27□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 S100A3P33764 101 aa-0.28□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 ASIPP42127 132 aa-0.28□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-0.28□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 TSLPQ969D9 159 aa-0.28□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 LINC00472Q9H8W2 130 aa-0.28□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-0.28□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 PKD1P98161 4303 aa-0.28□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 USF3Q68DE3 2245 aa-0.28□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 CEP250Q9BV73 2442 aa-0.28□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 C10orf71Q711Q0 1435 aa-0.29□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 CEP290O15078 2479 aa-0.29□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 DNAH5Q8TE73 4624 aa-0.29□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa-0.29□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 I3L2K1 104 aa-0.29□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 PRM1P04553 51 aa-0.29□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.29□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 Q6JHZ5 121 aa-0.29□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 FAM107BQ9H098 131 aa-0.29□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 NAA60Q9H7X0 242 aa-0.29□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa-0.29□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 MYH7P12883 1935 aa-0.29□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 SBF2Q86WG5 1849 aa-0.29□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 VPS13CQ709C8 3753 aa-0.29□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 BCL9LQ86UU0 1499 aa-0.29□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-0.29□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-0.29□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 NBASA2RRP1 2371 aa-0.3□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.3□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 SACSQ9NZJ4 4579 aa-0.3□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-0.3□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-0.3□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 F8VRH5 84 aa-0.3□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 COX17Q14061 63 aa-0.3□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 BAGE2Q86Y30 109 aa-0.3□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 MBD5Q9P267 1494 aa-0.3□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 PAPPAQ13219 1627 aa-0.31□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-0.31□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 IGLC7A0M8Q6 106 aa-0.31□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 UQCR11O14957 56 aa-0.31□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 DCDP81605 110 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 Q56UQ5 140 aa-0.31□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
RBM39-242ENST00000498280 PPP3R2Q96LZ3 170 aa-0.31□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 209.3 ms