RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PRKCZ-222	ENST00000496325	C5orf38	Q86SI9	138 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PRKCZ-222	ENST00000496325	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	IFITM10	A6NMD0	228 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325		K7EMI3	77 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	COX7A2L	O14548	114 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	MT-ND6	P03923	174 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM141	Q96I45	108 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGIP	A6NJ69	53 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAL	P21145	153 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	CHTF8	P0CG12	524 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	COX6A2	Q02221	97 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	YPEL4	Q96NS1	127 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	LINC01546	A6NGU7	62 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	TOMM6	Q96B49	74 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	AMELX	Q99217	191 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	UBE2D1	P51668	147 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-222	ENST00000496325	SYCN	Q0VAF6	134 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	CARD19	Q96LW7	228 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	VCX2	Q9H322	139 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	APOM	O95445	188 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	NPS	P0C0P6	89 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	G0S2	P27469	103 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325		Q6ZN92	141 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325		Q6ZRU5	148 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	FA2H	Q7L5A8	372 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	TIMM17A	Q99595	171 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325		A0A087WYN8	130 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325		A0A096LNI7	61 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPAG11B	Q08648	103 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	ERAS	Q7Z444	233 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	DPH3	Q96FX2	82 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	RNF213	Q63HN8	5207 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325		A0A087WZ39	114 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	C2orf48	Q96LS8	159 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325		A0A096LNJ9	63 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PRKCZ-222	ENST00000496325		A0A0J9YXV3	536 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	LINC00614	P0C842	121 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAJIN	Q3KP22	176 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	KIAA0087	Q14695	138 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	C10orf25	Q5T742	122 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	LINC01549	A6NIU2	74 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	GAGE2B	Q13066	116 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	PMCHL1	Q16048	86 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	STPG4	Q8N801	248 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	CST9L	Q9H4G1	147 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	NDUFA1	O15239	70 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	PTTG1IP	P53801	180 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	HERVK_113	P63121	156 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	RNF151	Q2KHN1	245 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	C2orf82	Q6UX34	121 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PRKCZ-222	ENST00000496325		F8WDY8	70 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PRKCZ-222	ENST00000496325	HBD	P02042	147 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PRKCZ-222	ENST00000496325	SEC11A	P67812	179 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PRKCZ-222	ENST00000496325	PMVK	Q15126	192 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PRKCZ-222	ENST00000496325	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PRKCZ-222	ENST00000496325	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		9.95	□□□□□ -0.82
PRKCZ-222	ENST00000496325	RAB5B	P61020	215 aa		9.95	□□□□□ -0.82

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