RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493853.1

RBM39-238, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 4

Gene RBM39, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-238	ENST00000493853	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	APOM	O95445	188 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	CKS2	P33552	79 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	PCP4	P48539	62 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	CAMP	P49913	170 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	ADIRF	Q15847	76 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853		V9GYV3	84 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	TCAP	O15273	167 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853		Q6ZRP5	223 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853		A0A1B0GW15	77 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853		F8W036	122 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	S100A8	P05109	93 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	PEA15	Q15121	130 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	RAB5A	P20339	215 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	MT-ND6	P03923	174 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	HBB	P68871	147 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853		Q6ZUT4	128 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853		D6R8Y8	96 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	PPBP	P02775	128 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853		A0A0J9YXV3	536 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853		A0A1W2PNN7	141 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853		F8WDY8	70 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	NDUFA1	O15239	70 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853		C9JQL5	133 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	NPY	P01303	97 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-238	ENST00000493853		A0A087WZ39	114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853		A0A1B0GVG6	124 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853		A0A1B0GXF2	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853		Q6ZN92	141 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	RAB14	P61106	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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