RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488576.5

FAM107B-222, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-222	ENST00000488576	PLN	P26678	52 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	ATP7B	P35670	1465 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	DAPK1	P53355	1430 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	GNG11	P61952	73 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	BLCAP	P62952	87 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	PPP3R1	P63098	170 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	ERVK-7	P63135	1459 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	CCL8	P80075	99 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	COL7A1	Q02388	2944 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	WT1-AS	Q06250	92 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	CATR1	Q13166	79 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	FAT1	Q14517	4588 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	FXYD3	Q14802	87 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	NCOA2	Q15596	1464 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	ETDB	Q3ZM63	59 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	MT1M	Q8N339	61 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	NEO1	Q92859	1461 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	LEAP2	Q969E1	77 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	TMEM203	Q969S6	136 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	CCDC115	Q96NT0	180 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	S100A13	Q99584	98 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	PRX	Q9BXM0	1461 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	UACA	Q9BZF9	1416 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	GNG13	Q9P2W3	67 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	PDZD2	O15018	2839 aa		-0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	HIVEP1	P15822	2718 aa		-0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	-0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	MUC2	Q02817	5179 aa		-0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	-0	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	PTPN13	Q12923	2485 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	LRP2	P98164	4655 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	ABCA4	P78363	2273 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
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FAM107B-222	ENST00000488576	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	COL4A5	P29400	1685 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	HERC1	Q15751	4861 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
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FAM107B-222	ENST00000488576	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	UNC13B	O14795	1591 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	PLXNC1	O60486	1568 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
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FAM107B-222	ENST00000488576	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	FANCA	O15360	1455 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	MED14	O60244	1454 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	PZP	P20742	1482 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	GOLGA3	Q08378	1498 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	EEA1	Q15075	1411 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	USH2A	O75445	5202 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	STAB1	Q9NY15	2570 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
FAM107B-222	ENST00000488576	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		-0.01	□□□□□ -2.41

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