RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486274.5

TBC1D23-208, Transcript of TBC1 domain family member 23, human

TSL 5

Gene TBC1D23, Length 4,054 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D23-208	ENST00000486274	REG3A	Q06141	175 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274		A0A0J9YWU9	116 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	TAX1BP3	O14907	124 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	NCR3	O14931	201 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	WFDC2	Q14508	124 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	LINC00694	P0DN24	101 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	CLEC2B	Q92478	149 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	NFE4	Q86UQ8	179 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	7.67	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274		U3KQK5	164 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274		G3V4G9	280 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	CARD19	Q96LW7	228 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274		A0A096LNJ9	63 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274		K7EP34	96 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	APC	P25054	2843 aa		7.65	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	UBE2B	P63146	152 aa		7.65	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274		A0A0J9YXY3	114 aa		7.64	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274		Q6ZTC4	211 aa		7.64	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	SIVA1	O15304	175 aa		7.64	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	CNFN	Q9BYD5	112 aa		7.64	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		7.64	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	HIVEP1	P15822	2718 aa		7.64	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	MIF	P14174	115 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	CUBN	O60494	3623 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	LYRM9	A8MSI8	78 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	SIGMAR1	Q99720	223 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	TAL2	Q16559	108 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274		A0A096LNI7	61 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274		A0A096LNT2	108 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	PRSS47	A8MTI9	375 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	CRYBA4	P53673	196 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	IGIP	A6NJ69	53 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	HAMP	P81172	84 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	TMEM223	A0PJW6	202 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	NDUFA1	O15239	70 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	COX6A2	Q02221	97 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	TMEM126A	Q9H061	195 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLPI	P03973	132 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	SPATA25	Q9BR10	227 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	C16orf95	Q9H693	158 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	UBE2D3	P61077	147 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	UBE2D2	P62837	147 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	HERV-K104	P63124	156 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	CELA1	Q9UNI1	258 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	FHL2	Q14192	279 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	RMI2	Q96E14	147 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274		Q8N2B8	174 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	HIGD1B	Q9P298	99 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	FSHB	P01225	129 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274		Q8N3U1	123 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274		F8W1H4	67 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	TCL1B	O95988	128 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	LINC01620	Q4KN68	170 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	IGKV2D-28	P01615	120 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	IFITM1	P13164	125 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	MIA	Q16674	131 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	LINC00315	P59091	139 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		7.54	□□□□□ -1.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89 ms