RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 APCP25054 2843 aa11.75□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PRX2 142 aa11.75□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 MALP21145 153 aa11.75□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 CFHR3Q02985 330 aa11.75□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 C4orf26Q17RF5 130 aa11.75□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 WFDC9Q8NEX5 89 aa11.75□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.74□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZSN1 163 aa11.74□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB131AP59861 70 aa11.73□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.73□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 NCR3O14931 201 aa11.73□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 PFN2P35080 140 aa11.73□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB121Q5J5C9 76 aa11.73□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 Q96MF0 132 aa11.73□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa11.73□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa11.72□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa11.71□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 LECT2O14960 151 aa11.71□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFA1O15239 70 aa11.71□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 PAX4O43316 350 aa11.71□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 FASNP49327 2511 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CCSAP-204ENST00000483092 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa11.71□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 APRG1Q8IVJ8 170 aa11.7□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 COPS9Q8WXC6 57 aa11.7□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 K7EMT4 169 aa11.7□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 DSCR9P59020 149 aa11.7□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L23D6RBM5 183 aa11.69□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV4-31P0DP07 118 aa11.69□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00846Q9NV44 126 aa11.69□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 K7EQG2 157 aa11.69□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa11.69□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF702PQ9H963 129 aa11.69□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.68□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa11.68□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 F5H768 121 aa11.68□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 A0A087WYN8 130 aa11.67□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 SERP2Q8N6R1 65 aa11.67□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 HILS1P60008 231 aa11.67□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 DPH3Q96FX2 82 aa11.67□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 C20orf197Q8N268 126 aa11.66□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2E2Q96LR5 201 aa11.66□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 ITPR2Q14571 2701 aa11.66□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CRYGAP11844 174 aa11.66□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 FAM104AQ969W3 186 aa11.66□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2L6O14933 153 aa11.66□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CXCL5P42830 114 aa11.66□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 DYNLRB2Q8TF09 96 aa11.66□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.65□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 Q6YL49 198 aa11.65□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 C5orf38Q86SI9 138 aa11.65□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF843Q8N446 348 aa11.65□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 A0A096LNT2 108 aa11.65□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa11.65□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00242Q5T6M2 205 aa11.65□□□□□ -0.54
CCSAP-204ENST00000483092 C2orf48Q96LS8 159 aa11.65□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 TIMM17BO60830 172 aa11.64□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 GHRHP01286 108 aa11.64□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 LINC01600Q96MT4 127 aa11.64□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 XCL2Q9UBD3 114 aa11.64□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa11.63□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF415Q09FC8 603 aa11.63□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM258P61165 79 aa11.63□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.62□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 WFDC11Q8NEX6 87 aa11.62□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM243Q9BU79 118 aa11.62□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 HIVEP2P31629 2446 aa11.62□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM11BQ8TCY0 68 aa11.62□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 CR1P17927 2039 aa11.62□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM1B2RUZ4 78 aa11.61□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 J3QLI3 93 aa11.61□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00337Q8N6G1 96 aa11.61□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf43Q9BWL3 253 aa11.61□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 HECTD1Q9ULT8 2610 aa11.61□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV25A0A0B4J276 109 aa11.6□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 ENHOQ6UWT2 76 aa11.6□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CCSAP-204ENST00000483092 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa11.58□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 TENM4Q6N022 2769 aa11.58□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 LINC01561Q8N1V8 128 aa11.58□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 OXTP01178 125 aa11.56□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 PKIGQ9Y2B9 76 aa11.56□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 RPS28P62857 69 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 HAMPP81172 84 aa11.55□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 FHL2Q14192 279 aa11.55□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.55□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 FAM222AQ5U5X8 452 aa11.55□□□□□ -0.56
CCSAP-204ENST00000483092 C22orf24Q9Y442 160 aa11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.4 ms