RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 TMEM141Q96I45 108 aa9□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 CHTF8P0CG12 524 aa8.99□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 C5orf38Q86SI9 138 aa8.99□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 IGIPA6NJ69 53 aa8.98□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.98□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 MALP21145 153 aa8.98□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 COX6A2Q02221 97 aa8.98□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.98□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 CARD19Q96LW7 228 aa8.98□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 LINC01546A6NGU7 62 aa8.97□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.97□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.97□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.97□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.97□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.97□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 AMELXQ99217 191 aa8.97□□□□□ -0.97
SRRT-210ENST00000477529 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.96□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 NPSP0C0P6 89 aa8.96□□□□□ -0.98
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SRRT-210ENST00000477529 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
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SRRT-210ENST00000477529 TOMM6Q96B49 74 aa8.96□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.96□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 A0A096LNI7 61 aa8.95□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 APOMO95445 188 aa8.95□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.95□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 SPAG11BQ08648 103 aa8.95□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 Q6ZN92 141 aa8.95□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.95□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 YPEL4Q96NS1 127 aa8.95□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 TIMM17AQ99595 171 aa8.95□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.95□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 G0S2P27469 103 aa8.94□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 Q6ZRU5 148 aa8.94□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.94□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.94□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 A0A087WYN8 130 aa8.93□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 A0A087WZ39 114 aa8.93□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.93□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.93□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 C2orf48Q96LS8 159 aa8.93□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.93□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 VCX2Q9H322 139 aa8.93□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 ERASQ7Z444 233 aa8.92□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.92□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.92□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.92□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.91□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 FA2HQ7L5A8 372 aa8.91□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.91□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.91□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.91□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.91□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 A0A096LNJ9 63 aa8.9□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 MAJINQ3KP22 176 aa8.9□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.9□□□□□ -0.98
SRRT-210ENST00000477529 LINC01549A6NIU2 74 aa8.89□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 KIAA0087Q14695 138 aa8.89□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.88□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 PTTG1IPP53801 180 aa8.88□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 C10orf25Q5T742 122 aa8.88□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.88□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 DPH3Q96FX2 82 aa8.88□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 A0A0J9YXV3 536 aa8.87□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 F8WDY8 70 aa8.87□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 NDUFA1O15239 70 aa8.87□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 HERVK_113P63121 156 aa8.87□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 RNF151Q2KHN1 245 aa8.87□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 STPG4Q8N801 248 aa8.87□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.87□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.87□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 SEC11AP67812 179 aa8.86□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.86□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 HBDP02042 147 aa8.85□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 LINC00614P0C842 121 aa8.85□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 GAGE2BQ13066 116 aa8.85□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 PMCHL1Q16048 86 aa8.85□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 C2orf82Q6UX34 121 aa8.85□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.85□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 PMVKQ15126 192 aa8.84□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.84□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 CST9LQ9H4G1 147 aa8.84□□□□□ -0.99
SRRT-210ENST00000477529 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.83□□□□□ -1
SRRT-210ENST00000477529 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.83□□□□□ -1
SRRT-210ENST00000477529 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.83□□□□□ -1
SRRT-210ENST00000477529 Q8IZM0 81 aa8.83□□□□□ -1
SRRT-210ENST00000477529 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.82□□□□□ -1
SRRT-210ENST00000477529 RAB5BP61020 215 aa8.82□□□□□ -1
SRRT-210ENST00000477529 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.82□□□□□ -1
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