RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 NPIPB3Q92617 1050 aa5.42□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.42□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.41□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 PLAC8L1A1L4L8 177 aa5.41□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 ID1P41134 155 aa5.41□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 HERVK_113P61574 105 aa5.41□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 DAD1P61803 113 aa5.41□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 GNG5P63218 68 aa5.41□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 ATXN8Q156A1 80 aa5.41□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.41□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.41□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.41□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 RNF125Q96EQ8 232 aa5.41□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 LINC01587Q99440 93 aa5.41□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.41□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.41□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.4□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 A0A0B4J2C4 111 aa5.4□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 A0A0J9YX75 114 aa5.4□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.4□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 CXCL5P42830 114 aa5.4□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 LAGE3Q14657 143 aa5.4□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.4□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 MORN5Q5VZ52 161 aa5.4□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.4□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 SGK494Q96LW2 274 aa5.4□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.4□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.4□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.4□□□□□ -1.54
SZRD1-208ENST00000476423 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.39□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 C9JAW5 83 aa5.39□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 SCGB2A1O75556 95 aa5.39□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 TCL1BO95988 128 aa5.39□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 PPP1R17O96001 155 aa5.39□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 IGLC6P0CF74 106 aa5.39□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 DEFB130BP0DP73 79 aa5.39□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 DEFB130AP0DP74 79 aa5.39□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 LYZP61626 148 aa5.39□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 SPINK13Q1W4C9 94 aa5.39□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.39□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.39□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 PRNTQ86SH4 94 aa5.39□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 RNF182Q8N6D2 247 aa5.39□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 BAALCQ8WXS3 180 aa5.39□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.39□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.38□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa5.38□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 A8MTW9 85 aa5.38□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 RS1O15537 224 aa5.38□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 TNFRSF6BO95407 300 aa5.38□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 CRYGAP11844 174 aa5.38□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 HAMPP81172 84 aa5.38□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 ODF3Q96PU9 254 aa5.38□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.38□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 LRP2P98164 4655 aa5.38□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.37□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 F5H768 121 aa5.37□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 INSP01308 110 aa5.37□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM258P61165 79 aa5.37□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.37□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.37□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.37□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.37□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 UBE2WQ96B02 151 aa5.37□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF815PA8K554 130 aa5.36□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 F8WDY8 70 aa5.36□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 H3BVH4 76 aa5.36□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 COX6CP09669 75 aa5.36□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 LINC01620Q4KN68 170 aa5.36□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.36□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 LINC00643Q86TS7 51 aa5.36□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 TOMM6Q96B49 74 aa5.36□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 RNF185Q96GF1 192 aa5.36□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 KIR2DL4Q99706 377 aa5.36□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.36□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 A0A087WTM6 91 aa5.35□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.35□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 A4D1N5 150 aa5.35□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 ATOX1O00244 68 aa5.35□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 SH2D1AO60880 128 aa5.35□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 CFC1BP0CG36 223 aa5.35□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 CFC1P0CG37 223 aa5.35□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 LINC00315P59091 139 aa5.35□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 LELP1Q5T871 98 aa5.35□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.35□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 C16orf92Q96LL3 132 aa5.35□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 SLC50A1Q9BRV3 221 aa5.35□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.35□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.34□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 A0A0J9YY99 117 aa5.34□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 RBAKDNA6NC62 111 aa5.34□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 LYRM9A8MSI8 78 aa5.34□□□□□ -1.55
SZRD1-208ENST00000476423 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.1 ms