RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 C2orf82Q6UX34 121 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.73□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.72□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 IFITM10A6NMD0 228 aa6.72□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 C9JQL5 133 aa6.72□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 NDUFA1O15239 70 aa6.72□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.72□□□□□ -1.33
ACTB-209ENST00000473257 M0QXV9 152 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 TNFRSF6BO95407 300 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 NPYP01303 97 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 CKS2P33552 79 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 FAM210AQ96ND0 272 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 D6R8Y8 96 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 PPP1R2P9O14990 202 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 UBE2BP63146 152 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 KIAA0087Q14695 138 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 ADIRFQ15847 76 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 IMMP2LQ96T52 175 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 TSPAN13O95857 204 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 PPP1R17O96001 155 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 HBBP68871 147 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 TMEM18Q96B42 140 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 C20orf78Q9BR46 151 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 UBE2D1P51668 147 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 AKAP14Q86UN6 197 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.67□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.66□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.66□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 LINC00862A6NCI5 91 aa6.65□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.65□□□□□ -1.34
ACTB-209ENST00000473257 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 A0A1B0GXF2 115 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 F8WDY8 70 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 NAT8Q9UHE5 227 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 A0A087X002 238 aa6.63□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.63□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 C22orf24Q9Y442 160 aa6.63□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 ZNF861PO60384 105 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 RAB5AP20339 215 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 TMEM141Q96I45 108 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 PRELID3AQ96N28 172 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 A0A1B0GW15 77 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 F8W036 122 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 ORMDL3Q8N138 153 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 MUC17Q685J3 4493 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 GAGE10A6NGK3 116 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 PRSS2P07478 247 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTB-209ENST00000473257 PPBPP02775 128 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 CKS1BP61024 79 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 A0A1B0GVG6 124 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 S100A8P05109 93 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 Q6ZN92 141 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 AMELXQ99217 191 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 VCX2Q9H322 139 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.57□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 SCO1O75880 301 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 PEA15Q15121 130 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ACTB-209ENST00000473257 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
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