RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.84□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.83□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa5.83□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.83□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 APOMO95445 188 aa5.83□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 SYCNQ0VAF6 134 aa5.83□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 TMEM141Q96I45 108 aa5.83□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 A0A087WYN8 130 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 IGIPA6NJ69 53 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 LCE2BO14633 110 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 SNAPINO95295 136 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 MT-ND6P03923 174 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 G0S2P27469 103 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 NDUFA5Q16718 116 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 SVBPQ8N300 66 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 CARD19Q96LW7 228 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 VCX2Q9H322 139 aa5.82□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 NPSP0C0P6 89 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 UBE2D1P51668 147 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 MAJINQ3KP22 176 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 Q6ZN92 141 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 Q6ZRU5 148 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 TOMM6Q96B49 74 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 C2orf48Q96LS8 159 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 AMELXQ99217 191 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 A0A096LNI7 61 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 LINC01546A6NGU7 62 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 SPAG11BQ08648 103 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 C2orf88Q9BSF0 95 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 A0A087WZ39 114 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 STPG4Q8N801 248 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 TIMM17AQ99595 171 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 F8WDY8 70 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 FA2HQ7L5A8 372 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 ERASQ7Z444 233 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-211ENST00000472027 A0A0J9YXV3 536 aa5.77□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 LINC01549A6NIU2 74 aa5.77□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 PTTG1IPP53801 180 aa5.77□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 GAGE2BQ13066 116 aa5.77□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 KIAA0087Q14695 138 aa5.77□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 RNF151Q2KHN1 245 aa5.77□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.77□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 NDUFA1O15239 70 aa5.76□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 LINC00614P0C842 121 aa5.76□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 HERVK_113P63121 156 aa5.76□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 SEC11AP67812 179 aa5.76□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 C10orf25Q5T742 122 aa5.76□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.76□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa5.76□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.76□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.76□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 YPEL4Q96NS1 127 aa5.76□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 C7orf33Q8WU49 177 aa5.75□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.75□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.75□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PNN7 141 aa5.74□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 CST9LQ9H4G1 147 aa5.74□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 A0A096LNJ9 63 aa5.73□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.73□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 PRSS2P07478 247 aa5.73□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.73□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 RAB5BP61020 215 aa5.73□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 PMVKQ15126 192 aa5.73□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.73□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 C2orf82Q6UX34 121 aa5.73□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.73□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.73□□□□□ -1.49
SYN3-211ENST00000472027 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.72□□□□□ -1.49
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