RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 PLNP26678 52 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC01545Q5VT33 79 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 H3BRM9 83 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 COX7A2LO14548 114 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 DPM2O94777 84 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKCP01834 107 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 COX6A2Q02221 97 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 FOXI1Q12951 378 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 CFAP161Q6P656 301 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A087WZ39 114 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 C11orf86A6NJI1 115 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 APOMO95445 188 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 MALP21145 153 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 C5orf38Q86SI9 138 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 LYSTQ99698 3801 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 SCGB1D1O95968 90 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 C14orf177Q52M58 125 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 HERVK_113P61574 105 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM223A0PJW6 202 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 USP17L23D6RBM5 183 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 EREGO14944 169 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 RTL8CO15255 209 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 PRSS2P07478 247 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 SPINK8P0C7L1 97 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 KMT2AQ03164 3969 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A087WTM6 91 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 hDV102S1A0JD36 115 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 LECT2O14960 151 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 SPAG11BQ08648 103 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 ATOH7Q8N100 152 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 C15orf56Q8N910 161 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 E9PLD3 99 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 F8WDY8 70 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 LEPROTO15243 131 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 Q8IZM0 81 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 STPG4Q8N801 248 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 COX7B2Q8TF08 81 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 CXCL5P42830 114 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 CKS1BP61024 79 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 TNP2Q05952 138 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 WFDC2Q14508 124 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 PYY3Q5JQD4 70 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 SFTA2Q6UW10 78 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 Q8N814 137 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 C2orf48Q96LS8 159 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA0087Q14695 138 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 J3QQQ9 107 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFA1O15239 70 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 NMUP48645 174 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 VAMP8Q9BV40 100 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP4-208ENST00000462602 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 SYCNQ0VAF6 134 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM6P0DI80 62 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 HERV-K104P63124 156 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 S100A12P80511 92 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 MAJINQ3KP22 176 aa6.13□□□□□ -1.43
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