RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 C9JQL5 133 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 SPAG11BQ08648 103 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM18Q96B42 140 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 C20orf78Q9BR46 151 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 TNFRSF6BO95407 300 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 MT-ND6P03923 174 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 PEA15Q15121 130 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM104AQ969W3 186 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 NAT8Q9UHE5 227 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1B0GW15 77 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00862A6NCI5 91 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 D6R8Y8 96 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 IFITM10A6NMD0 228 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 TCAPO15273 167 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB14P61106 215 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF151Q2KHN1 245 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 C1orf137Q5JT78 98 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM168BA1KXE4 195 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 F8W036 122 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 NPYP01303 97 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 S100A8P05109 93 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 HBBP68871 147 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 C10orf25Q5T742 122 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1B0GXF2 115 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 NDUFA1O15239 70 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 IMMP2LQ96T52 175 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 LPAP08519 4548 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A087WZ39 114 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 GAGE2EQ4V326 116 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 F8WDY8 70 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 PPBPP02775 128 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB5AP20339 215 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 ORMDL3Q8N138 153 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 PRELID3AQ96N28 172 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-206ENST00000446904 IGLV7-43P04211 117 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 CLLU1Q5K131 121 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 DIRC1Q969H9 104 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 KIAA0087Q14695 138 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 C2orf82Q6UX34 121 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM141Q96I45 108 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 H0Y9J4 135 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 M0QXV9 152 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 UBE2D1P51668 147 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 UBE2BP63146 152 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 UQCC3Q6UW78 93 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 IFITM2Q01629 132 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4-206ENST00000446904 PRSS47A8MTI9 375 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4-206ENST00000446904 MT-ND4LP03901 98 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4-206ENST00000446904 Q6ZN92 141 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4-206ENST00000446904 Q8N8P6 123 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4-206ENST00000446904 VCX2Q9H322 139 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4-206ENST00000446904 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.2□□□□□ -1.42
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