RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434424.5

PTPRK-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-212ENST00000434424 K7EIM0 57 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 TCL1BO95988 128 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 HLA-DRB4P13762 266 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 GNG2P59768 71 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 KRTAP10-1P60331 282 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 WT1-ASQ06250 92 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 SS18Q15532 418 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 NDUFA5Q16718 116 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 KHDC3LQ587J8 217 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 TOMM20LQ6UXN7 152 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 DPPA3Q6W0C5 159 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 OR4B1Q8NGF8 309 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 TSC22D3Q99576 134 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 TRAV3A0A0B4J244 114 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 A0A0D9SG52 128 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 HMSDA8MTL9 139 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 CORTO00230 105 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 TAX1BP3O14907 124 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 SDC2P34741 201 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 SNCAP37840 140 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 DCANP1Q8TF63 244 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 LINC00052Q96N35 136 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 A0A087WTM6 91 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 TRGC1P0CF51 173 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 S100GP29377 79 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 PSG9Q00887 426 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 MSMO1Q15800 293 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 SAMD13Q5VXD3 122 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 FOXI2Q6ZQN5 318 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 NUP35Q8NFH5 326 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 OR5A1Q8NGJ0 315 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 MAFIPQ8WZ33 124 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 EPDR1Q9UM22 224 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRK-212ENST00000434424 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 MEIS3P1A6NDR6 274 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 I3L2K1 104 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 J3QQQ9 107 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 K7EP13 123 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 IGKV4-1P06312 121 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 NBEAP1P0C6P0 100 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 METTL15P1P0C7V9 234 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 PDCD10Q9BUL8 212 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 H3BNG1 76 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 NCS1P62166 190 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 LSM3P62310 102 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 HAMPP81172 84 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 Q6ZTI0 123 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 OR5H6Q8NGV6 325 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 A0A0J9YY99 117 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 A0A1W2PRE2 83 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 PPYP01298 95 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 HTN1P15515 57 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 EVI2AP22794 236 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 FXYD4P59646 89 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 ESRGQ1W209 222 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 SLC35B3Q9H1N7 401 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 RPRMQ9NS64 109 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 PKD1P98161 4303 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 TRAV5A0A0B4J249 113 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 FAM25AB3EWG3 89 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 FAM25CB3EWG5 89 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 FAM25GB3EWG6 89 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 M0R378 163 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 PRCDQ00LT1 54 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 LCN15Q6UWW0 184 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 MBD3L1Q8WWY6 194 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 CCDC32Q9BV29 185 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 DPH3P1Q9H4G8 78 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 BATF3Q9NR55 127 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 COMMD3Q9UBI1 195 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 LY96Q9Y6Y9 160 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 ETV6P41212 452 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 TMBIM6P55061 237 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 UBE2BP63146 152 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM128Q5BJH2 165 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 SNX29P2Q8IUI4 249 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 FXYD6Q9H0Q3 95 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 A0A0G2JQZ4 141 aa3.53□□□□□ -1.84
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