RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428450.5

DDX39B-209, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 4

Gene DDX39B, Length 633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-209ENST00000428450 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.77□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 GNG13Q9P2W3 67 aa6.77□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.76□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 CAMPP49913 170 aa6.76□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 UBE2G2P60604 165 aa6.76□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 COX19Q49B96 90 aa6.76□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.76□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 FMC1Q96HJ9 113 aa6.76□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 AP1S3Q96PC3 154 aa6.76□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 CDIP1Q9H305 208 aa6.76□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 COTL1Q14019 142 aa6.75□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 TPRXLQ17RH7 258 aa6.75□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 NUP35Q8NFH5 326 aa6.75□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.74□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 CCL25O15444 150 aa6.74□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 PDE6DO43924 150 aa6.74□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 APOMO95445 188 aa6.74□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 MGPP08493 103 aa6.74□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 UBE2G1P62253 170 aa6.74□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 RASL11AQ6T310 242 aa6.74□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.73□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 ADIRFQ15847 76 aa6.73□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.73□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.73□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.73□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.73□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.73□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.73□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 MLST8Q9BVC4 326 aa6.73□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 A0A1B0GV50 99 aa6.72□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 FAM168BA1KXE4 195 aa6.72□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 CEBPGP53567 150 aa6.72□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 NTF3P20783 257 aa6.71□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 CTRLP40313 264 aa6.71□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.71□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 LINC01551Q86U37 167 aa6.71□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.71□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 A0A087X002 238 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 C20orf202A1L168 122 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 H7C423 109 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 SCGB1D1O95968 90 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 PCP4P48539 62 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 TSKUQ8WUA8 353 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 NPSP0C0P6 89 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 G0S2P27469 103 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 C11orf52Q96A22 123 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 VAMP8Q9BV40 100 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 CRYGAP11844 174 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 LINC00310P59036 64 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 C2orf48Q96LS8 159 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 IGLC6P0CF74 106 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 RNF151Q2KHN1 245 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF861PO60384 105 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 NCR2O95944 276 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 PPBPP02775 128 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 IGLC3P0DOY3 106 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 SS18Q15532 418 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 NUPR1O60356 82 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 PAGE4O60829 102 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 APCSP02743 223 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 UBE2V1Q13404 147 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 PMCHL1Q16048 86 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 PET117Q6UWS5 81 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 GATD1Q8NB37 220 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 TPPP3Q9BW30 176 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-209ENST00000428450 MALP21145 153 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 UBE2BP63146 152 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 LCE2CQ5TA81 110 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 BAGE2Q86Y30 109 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM101Q96IK0 257 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 OSTCQ9NRP0 149 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.64□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 COX7A2LO14548 114 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 SERF1AO75920 110 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 CST9LP1Q5W188 147 aa6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 M0QXV9 152 aa6.62□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.62□□□□□ -1.35
DDX39B-209ENST00000428450 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.62□□□□□ -1.35
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