RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 M0QY20 66 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 PROK1P58294 105 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 C6orf99Q4VX62 202 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2D2P62837 147 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2D3P61077 147 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 LST1O00453 97 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 PRR9Q5T870 116 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 COX7CP15954 63 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZQY7 126 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 SNURFQ9Y675 71 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf195Q5TG92 126 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 Q8N6K4 173 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 COX17Q14061 63 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 C3orf84H3BNL1 204 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 TSHBP01222 138 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZVQ6 151 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 C19orf84I3L1E1 186 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00694P0DN24 101 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 LELP1Q5T871 98 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 Q6YL49 198 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 M0QXV9 152 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 PRM2P04554 102 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 Q6JHZ5 121 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.36
PTPRM-202ENST00000400053 PRYO14603 147 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 PRORYQ9H606 182 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 DCANP1Q8TF63 244 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 PRR4Q16378 134 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0J9YWU9 116 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZSV7 163 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 A0A096LNJ9 63 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 CNFNQ9BYD5 112 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 COL4A2P08572 1712 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 IGIPA6NJ69 53 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 C10orf25Q5T742 122 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 Q6Q795 121 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 A0A087WVE0 104 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV2D-28P01615 120 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 Q8IZM0 81 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 AGRNO00468 2067 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 KLLNB2CW77 178 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 PMAIP1Q13794 54 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 CDSNQ15517 529 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 LAMA3Q16787 3333 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF580Q9UK33 172 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00208Q96KT6 92 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-202ENST00000400053 F8WDY8 70 aa6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms