RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.77□□□□□ -1.65
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RABGEF1-202ENST00000380828 RNF223E7ERA6 249 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-202ENST00000380828 MGPP08493 103 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-202ENST00000380828 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa4.77□□□□□ -1.65
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RABGEF1-202ENST00000380828 PTPN13Q12923 2485 aa4.76□□□□□ -1.65
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RABGEF1-202ENST00000380828 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.75□□□□□ -1.65
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RABGEF1-202ENST00000380828 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.74□□□□□ -1.65
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RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.74□□□□□ -1.65
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNRD1Q9P1U0 126 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-202ENST00000380828 PRCDQ00LT1 54 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-202ENST00000380828 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa4.73□□□□□ -1.65
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RABGEF1-202ENST00000380828 C3orf84H3BNL1 204 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-202ENST00000380828 C10orf55Q5SWW7 151 aa4.73□□□□□ -1.65
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RABGEF1-202ENST00000380828 C19orf84I3L1E1 186 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-202ENST00000380828 NCR3O14931 201 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-202ENST00000380828 BCE1O60756 84 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV3-15P01624 115 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-202ENST00000380828 WT1-ASQ06250 92 aa4.73□□□□□ -1.65
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RABGEF1-202ENST00000380828 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.72□□□□□ -1.65
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RABGEF1-202ENST00000380828 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa4.72□□□□□ -1.65
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RABGEF1-202ENST00000380828 NOTCH2Q04721 2471 aa4.7□□□□□ -1.66
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RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB109BQ30KR1 87 aa4.69□□□□□ -1.66
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RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZTI0 123 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
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RABGEF1-202ENST00000380828 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.68□□□□□ -1.66
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