RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 C20orf197Q8N268 126 aa14.8□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa14.79□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 CCKP06307 115 aa14.79□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFA7O95182 113 aa14.79□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 M0R378 163 aa14.78□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZQY7 126 aa14.78□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00526Q96FQ7 95 aa14.78□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa14.78□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 CLUHP3Q96NS8 147 aa14.77□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 UQCRQO14949 82 aa14.77□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 IGIPA6NJ69 53 aa14.76□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFC2O95298 119 aa14.76□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 MUC7Q8TAX7 377 aa14.76□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 LST1O00453 97 aa14.76□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf158Q8N1D5 194 aa14.76□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.76□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 LRP4O75096 1905 aa14.76□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa14.75□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 IGKV2D-28P01615 120 aa14.75□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 LRCOL1A6NCL2 159 aa14.75□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 ENHOQ6UWT2 76 aa14.75□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 SCXQ7RTU7 201 aa14.75□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 Q8IZM0 81 aa14.74□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 PLA2G2AP14555 144 aa14.74□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 COX17Q14061 63 aa14.74□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP10-9P60411 292 aa14.74□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa14.74□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 BRI3O95415 125 aa14.73□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.73□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 MTORP42345 2549 aa14.73□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PPR1 153 aa14.73□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.72□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.72□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 C7orf33Q8WU49 177 aa14.72□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa14.72□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV1-51P01701 117 aa14.71□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00242Q5T6M2 205 aa14.71□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF580Q9UK33 172 aa14.71□□□□□ -0.05
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM11BQ8TCY0 68 aa14.71□□□□□ -0.06
CCSAP-203ENST00000366687 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L23D6RBM5 183 aa14.7□□□□□ -0.06
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00310P59036 64 aa14.7□□□□□ -0.06
CCSAP-203ENST00000366687 EDN2P20800 178 aa14.7□□□□□ -0.06
CCSAP-203ENST00000366687 SEC61GP60059 68 aa14.7□□□□□ -0.06
CCSAP-203ENST00000366687 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa14.68□□□□□ -0.06
CCSAP-203ENST00000366687 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.68□□□□□ -0.06
CCSAP-203ENST00000366687 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.68□□□□□ -0.06
CCSAP-203ENST00000366687 CHCHD7Q9BUK0 85 aa14.68□□□□□ -0.06
CCSAP-203ENST00000366687 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.68□□□□□ -0.06
CCSAP-203ENST00000366687 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa14.67□□□□□ -0.06
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CCSAP-203ENST00000366687 C3orf84H3BNL1 204 aa14.67□□□□□ -0.06
CCSAP-203ENST00000366687 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CCSAP-203ENST00000366687 IMUPQ9GZP8 106 aa14.66□□□□□ -0.06
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0J9YWU9 116 aa14.65□□□□□ -0.06
CCSAP-203ENST00000366687 SMR3AQ99954 134 aa14.65□□□□□ -0.06
CCSAP-203ENST00000366687 CASC2Q6XLA1 102 aa14.64□□□□□ -0.07
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CCSAP-203ENST00000366687 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CCSAP-203ENST00000366687 PPDPFQ9H3Y8 114 aa14.63□□□□□ -0.07
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM1B2RUZ4 78 aa14.62□□□□□ -0.07
CCSAP-203ENST00000366687 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa14.62□□□□□ -0.07
CCSAP-203ENST00000366687 FAM236CP0DP71 79 aa14.62□□□□□ -0.07
CCSAP-203ENST00000366687 WFDC10BQ8IUB3 73 aa14.62□□□□□ -0.07
CCSAP-203ENST00000366687 M0R2N4 97 aa14.62□□□□□ -0.07
CCSAP-203ENST00000366687 C3orf22Q8N5N4 141 aa14.61□□□□□ -0.07
CCSAP-203ENST00000366687 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa14.61□□□□□ -0.07
CCSAP-203ENST00000366687 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa14.6□□□□□ -0.07
CCSAP-203ENST00000366687 EP400Q96L91 3159 aa14.6□□□□□ -0.07
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00474Q9P2X8 69 aa14.6□□□□□ -0.07
CCSAP-203ENST00000366687 RPL37AP8A6NKH3 93 aa14.59□□□□□ -0.07
CCSAP-203ENST00000366687 CENPFP49454 3210 aa14.59□□□□□ -0.07
CCSAP-203ENST00000366687 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCSAP-203ENST00000366687 PTPRSQ13332 1948 aa14.59□□□□□ -0.07
CCSAP-203ENST00000366687 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa14.58□□□□□ -0.08
CCSAP-203ENST00000366687 SERP2Q8N6R1 65 aa14.58□□□□□ -0.08
CCSAP-203ENST00000366687 C16orf95Q9H693 158 aa14.57□□□□□ -0.08
CCSAP-203ENST00000366687 SPINK6Q6UWN8 80 aa14.56□□□□□ -0.08
CCSAP-203ENST00000366687 FHL2Q14192 279 aa14.55□□□□□ -0.08
CCSAP-203ENST00000366687 BEAN1Q3B7T3 259 aa14.55□□□□□ -0.08
CCSAP-203ENST00000366687 EML5Q05BV3 1969 aa14.55□□□□□ -0.08
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa14.55□□□□□ -0.08
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00694P0DN24 101 aa14.54□□□□□ -0.08
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFC1O43677 76 aa14.54□□□□□ -0.08
CCSAP-203ENST00000366687 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.54□□□□□ -0.08
CCSAP-203ENST00000366687 AMELXQ99217 191 aa14.54□□□□□ -0.08
CCSAP-203ENST00000366687 LY6G6CO95867 125 aa14.53□□□□□ -0.08
CCSAP-203ENST00000366687 WFDC13Q8IUB5 93 aa14.53□□□□□ -0.08
CCSAP-203ENST00000366687 BRK1Q8WUW1 75 aa14.53□□□□□ -0.08
CCSAP-203ENST00000366687 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.52□□□□□ -0.09
CCSAP-203ENST00000366687 RPL28P46779 137 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CCSAP-203ENST00000366687 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CCSAP-203ENST00000366687 RETNQ9HD89 108 aa14.51□□□□□ -0.09
CCSAP-203ENST00000366687 A0A096LNJ9 63 aa14.5□□□□□ -0.09
CCSAP-203ENST00000366687 COX6A2Q02221 97 aa14.5□□□□□ -0.09
CCSAP-203ENST00000366687 TSPEAR-AS2P59090 65 aa14.49□□□□□ -0.09
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZTC4 211 aa14.49□□□□□ -0.09
CCSAP-203ENST00000366687 XGP55808 180 aa14.49□□□□□ -0.09
CCSAP-203ENST00000366687 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms